61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0519 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 410 aa  824    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  47.43 
 
 		 406 aa  388  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  43.96 
 
 		 419 aa  375  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  44.15 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  45.57 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  43.03 
 
 		 419 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  43.24 
 
 		 419 aa  352  5e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  42.45 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  42.09 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  41.25 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  42.21 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  41.97 
 
 		 423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  42.31 
 
 		 419 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  42.31 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  40.69 
 
 		 415 aa  316  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  40.48 
 
 		 428 aa  315  6e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  40 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  39.12 
 
 		 417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  39.85 
 
 		 419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  39.56 
 
 		 417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  39.6 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  37.02 
 
 		 426 aa  292  6e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  39.48 
 
 		 338 aa  268  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  37.06 
 
 		 357 aa  266  7e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  34.15 
 
 		 435 aa  256  6e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  38.79 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  32.77 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  33.98 
 
 		 436 aa  246  4e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  33.5 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  40.65 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  40.65 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  40.65 
 
 		 385 aa  236  8e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  40.19 
 
 		 385 aa  235  9e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  33.33 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  29.24 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  28.57 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  25.76 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  31.45 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  27.64 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  28.25 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  25.26 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  26.9 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  23.08 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  22.55 
 
 		 347 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  25.24 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01810  hypothetical protein  26.07 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  24.24 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  24.75 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  24.24 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  26.26 
 
 		 341 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  26 
 
 		 342 aa  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  25.55 
 
 		 344 aa  47.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  24.19 
 
 		 355 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  28.57 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  23.2 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  23.81 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  25.11 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  24.88 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  25.09 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4445  hypothetical protein  28 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  26.32 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>