More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4098 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4098  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 418 aa  824    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  55.67 
 
 		 398 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5370  cysteine desulfurase family protein  54.16 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  54.16 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5077  cysteine desulfurase family protein  54.16 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  52.9 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5616  cysteine desulfurase family protein  51.39 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316888  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1188  cysteine desulfurase family protein  50.63 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  51.38 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  51.64 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  44.39 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  42.86 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  42.61 
 
 		 403 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  37.72 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  35.64 
 
 		 399 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  37.13 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  31.33 
 
 		 410 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  34 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  28.45 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  29.44 
 
 		 411 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  28.82 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  28.84 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  29.5 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  27.1 
 
 		 418 aa  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  29.23 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  28.72 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  30.94 
 
 		 410 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  32.17 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  30.77 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  29.43 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  26.3 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  32.03 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  29.02 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  28.12 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  28.99 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  28.74 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.18 
 
 		 428 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.56 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.84 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  26.84 
 
 		 413 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.64 
 
 		 415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  27.43 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.6 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  23.7 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.87 
 
 		 419 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.12 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  27.12 
 
 		 411 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  25.6 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.12 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.36 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  26.52 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  25.36 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.59 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  26.86 
 
 		 682 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.23 
 
 		 644 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  24.64 
 
 		 414 aa  106  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.12 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  23.92 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  23.92 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  26.29 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  24.4 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.66 
 
 		 423 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.42 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.32 
 
 		 679 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  25.66 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  24.05 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  26 
 
 		 688 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.1 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  26.27 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  24.52 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  25.4 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  27.1 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.9 
 
 		 650 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.38 
 
 		 408 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.45 
 
 		 605 aa  99.8  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.9 
 
 		 666 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.74 
 
 		 673 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.94 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.47 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.42 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.78 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.5 
 
 		 441 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.82 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.55 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.88 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.18 
 
 		 678 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.39 
 
 		 664 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.18 
 
 		 657 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  25.66 
 
 		 666 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  23.67 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  26.23 
 
 		 604 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.77 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  24.34 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.58 
 
 		 413 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  26.23 
 
 		 604 aa  97.1  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.58 
 
 		 413 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.08 
 
 		 429 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.53 
 
 		 621 aa  97.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.75 
 
 		 451 aa  97.1  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.18 
 
 		 630 aa  97.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>