More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2183 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2183  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 265 aa  507  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0185108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  42.04 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  37.75 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  34.62 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  31.86 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  45.05 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 361 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.05 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6278  Alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  30.62 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1163  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  28.36 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 340 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  23 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1566  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  22.13 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  20.1 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  21.76 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  21.18 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.95 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.87 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.75 
 
 		 371 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  22.27 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  25.77 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  20.99 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  31.89 
 
 		 413 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  31.89 
 
 		 413 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  31.89 
 
 		 413 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  24.6 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.08 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  26.88 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  18.92 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 540 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  32.09 
 
 		 436 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.37 
 
 		 425 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  27.97 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  20.57 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.81 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.81 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.71 
 
 		 370 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  29.38 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  26.54 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  22.78 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 299 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  34.26 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  20.78 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>