225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3391 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3391  transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  623  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  35.78 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  35.6 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  34.42 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  33.11 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  33.11 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  33.95 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  32.12 
 
 		 367 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  26.2 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  27.16 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  26.28 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  27.46 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  27.09 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  28.25 
 
 		 376 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  25.43 
 
 		 393 aa  97.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  30.88 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  25.46 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.03 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  29.51 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  30.09 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  27.35 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  28.29 
 
 		 374 aa  92.4  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  27.35 
 
 		 334 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  24.78 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  28.36 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  29.27 
 
 		 336 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  28.83 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  30.26 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2087  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.89 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  29.32 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  26.77 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  26.49 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  25.85 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  30.09 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 337 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  28.96 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  29.75 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  28.7 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  28.7 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  28.7 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  28.7 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  28.7 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  28.7 
 
 		 337 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  27.89 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  28.08 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  28.08 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  27.04 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  24.28 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  29.38 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  25.99 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2609  hypothetical protein  31.08 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  24.51 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  28.83 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  25.08 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  38.2 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  53.23 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  34.29 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  53.23 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  27.48 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  37 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  26.84 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  22.12 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  23 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  22.49 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  36.31 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  30.61 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  39.74 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  38.39 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  29.01 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  22.4 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  35.21 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2308  hypothetical protein  30 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  35.56 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3660  hypothetical protein  30.43 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0081  hypothetical protein  30.38 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  51.47 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  36.75 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  34.38 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  27.69 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  45.45 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  36.75 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>