193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0579 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
202 aa  401  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  56.99 
 
 
212 aa  232  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  56.78 
 
 
201 aa  232  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  56.99 
 
 
212 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  53.57 
 
 
203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  59.07 
 
 
195 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  54.92 
 
 
232 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  53.3 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  54.59 
 
 
232 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  54.31 
 
 
208 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  55.33 
 
 
208 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  51.27 
 
 
208 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  51.27 
 
 
208 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  53.81 
 
 
208 aa  201  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  51.03 
 
 
223 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  48.48 
 
 
204 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  38.3 
 
 
197 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  38.38 
 
 
195 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  38.3 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  42.78 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  38.3 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  37.17 
 
 
196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  37.3 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  37.23 
 
 
201 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 
219 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  39.18 
 
 
197 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 
205 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 
218 aa  104  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 
204 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  37.89 
 
 
204 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
203 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 
219 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 
204 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  35.83 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 
195 aa  97.8  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  35.23 
 
 
201 aa  96.3  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 
210 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  38.62 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 
200 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  34.02 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  34.33 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  33.83 
 
 
200 aa  94.7  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  34.03 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 
199 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  33.16 
 
 
199 aa  91.7  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  36.18 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  32.29 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 
218 aa  89  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 
203 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 
201 aa  89  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 
206 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  34.05 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  30.93 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  32.82 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  30.93 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  32.81 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  31.05 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  28.19 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  28.87 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  32.46 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  26.98 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  30.98 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>