More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1517 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1517  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  781    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0196221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.72 
 
 
784 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.72 
 
 
818 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.69 
 
 
632 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.81 
 
 
1056 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.22 
 
 
1022 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  31.75 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 
4079 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.88 
 
 
1694 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  39.08 
 
 
1276 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 
512 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.65 
 
 
810 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.52 
 
 
1056 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
1421 aa  66.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 
1192 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.16 
 
 
988 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
747 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
878 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
543 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
306 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  30.25 
 
 
564 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 
591 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
371 aa  63.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  38 
 
 
417 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
392 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
4489 aa  62.8  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
605 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.52 
 
 
725 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
173 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
927 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 
3560 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  36.08 
 
 
887 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
562 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1276 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
279 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 
406 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
416 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 
406 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
266 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  34.07 
 
 
462 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
269 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 
237 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1428  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 
413 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
289 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 
784 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.06 
 
 
778 aa  59.7  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  43.02 
 
 
636 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
3035 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
1094 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
290 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
740 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 
162 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.66 
 
 
573 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
289 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.87 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.57 
 
 
1138 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 
523 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.94 
 
 
1979 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.61 
 
 
267 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1631  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.0840181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.94 
 
 
439 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
205 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43199  predicted protein  30.82 
 
 
214 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.847527  normal  0.232637 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
254 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
240 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.33 
 
 
1007 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  27.46 
 
 
252 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
515 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
602 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 
594 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  29.92 
 
 
1240 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
357 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.56 
 
 
439 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
331 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.68 
 
 
730 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
566 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
297 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
425 aa  57.4  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.62 
 
 
745 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
543 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
250 aa  56.6  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
211 aa  56.6  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2001  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
193 aa  56.6  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal  0.236756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
213 aa  56.6  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
279 aa  56.2  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
244 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
388 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
388 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.37 
 
 
623 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
202 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
683 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
1737 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  32.26 
 
 
581 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
699 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>