82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1674 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
247 aa  474  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  63.05 
 
 
246 aa  289  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  65.59 
 
 
246 aa  285  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  60.73 
 
 
253 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  59.07 
 
 
237 aa  265  5e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  51.82 
 
 
247 aa  231  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  50.2 
 
 
247 aa  217  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  51.82 
 
 
255 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  50.2 
 
 
245 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  48.99 
 
 
245 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  53.04 
 
 
247 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  48.58 
 
 
245 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  51.42 
 
 
246 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  52.02 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  51.24 
 
 
244 aa  181  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  46.22 
 
 
245 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  47.01 
 
 
234 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  46.61 
 
 
245 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  46.06 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  45.04 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  46.28 
 
 
246 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  41.3 
 
 
245 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  46.15 
 
 
249 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  42.51 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  40.4 
 
 
245 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  39.92 
 
 
245 aa  131  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  38.46 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  40.24 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  39.04 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  39.42 
 
 
245 aa  121  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  35.54 
 
 
245 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  35.54 
 
 
245 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  35.54 
 
 
245 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  29.63 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  29.54 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  26.92 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  29.25 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  26.03 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  34.85 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  23.18 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  26.43 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  28.27 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  26.53 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  25.64 
 
 
238 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3033  protein of unknown function DUF164  23.58 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  26.94 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  26.97 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  30.29 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  24.69 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  26.97 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1218  protein of unknown function DUF164  25.93 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0613005  hitchhiker  0.00414644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  27.65 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  28 
 
 
237 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  22.18 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  26.67 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  34.12 
 
 
116 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  24.06 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  22.81 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  22.86 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  21.63 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  28.21 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.51 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  22.13 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  23.5 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  24.69 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  27.74 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  27.81 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  25.41 
 
 
239 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  28.87 
 
 
246 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  26.95 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  21.31 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  22.16 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  21.22 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  27.66 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  23.77 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  21.28 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0656  hypothetical protein  24.89 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  25.68 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  25.68 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  25.68 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03363  Kinesin-like protein bimC [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P17120]  27.78 
 
 
1184 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0978354  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  22.35 
 
 
254 aa  42  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>