49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1662 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  788    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  44.14 
 
 		 369 aa  186  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2079  hypothetical protein  56.77 
 
 		 161 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0491227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0250  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 335 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  37.05 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  36.98 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  35.51 
 
 		 514 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  34.51 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1019  hypothetical protein  34.04 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  31.21 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  35.04 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  48.98 
 
 		 470 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  28.46 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  33.22 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 282 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  37.41 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  41.75 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2821  helix-turn-helix domain protein  46.67 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803112  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  27.53 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  30.31 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  49.4 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  25.9 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  27.45 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  29.26 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1749  hypothetical protein  35.16 
 
 		 107 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.558396  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0510  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  28.97 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  25.12 
 
 		 554 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4244  formylmethionine deformylase  36.56 
 
 		 549 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 507 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5529  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 327 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  25.91 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.07 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  30.32 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.64 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  28.9 
 
 		 519 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  27.06 
 
 		 477 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  27.49 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4907  transcriptional regulator, XRE family  26.89 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  26.06 
 
 		 503 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  28.09 
 
 		 449 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0917  hypothetical protein  26.37 
 
 		 342 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>