More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0668 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  100 
 
 
796 aa  1585    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  39.55 
 
 
842 aa  445  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  35.12 
 
 
752 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.61 
 
 
729 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.89 
 
 
732 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.82 
 
 
735 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  35.83 
 
 
731 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  33.79 
 
 
735 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  35.06 
 
 
750 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  34.73 
 
 
723 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  34.39 
 
 
740 aa  372  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  37.45 
 
 
723 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  33.66 
 
 
734 aa  361  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  33.77 
 
 
728 aa  359  9e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  32.37 
 
 
737 aa  356  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  34.35 
 
 
832 aa  353  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  32.06 
 
 
742 aa  346  8.999999999999999e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  29.86 
 
 
829 aa  343  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  29.86 
 
 
829 aa  343  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  32.92 
 
 
732 aa  340  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  33.46 
 
 
735 aa  340  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  37.77 
 
 
751 aa  337  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.98 
 
 
717 aa  334  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  34.43 
 
 
714 aa  333  9e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  33.63 
 
 
735 aa  332  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  34.34 
 
 
1002 aa  331  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  36.18 
 
 
761 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  34.07 
 
 
724 aa  323  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  34.55 
 
 
903 aa  316  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  31.01 
 
 
779 aa  314  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  32.12 
 
 
917 aa  312  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.32 
 
 
746 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  29.69 
 
 
893 aa  304  5.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  33.25 
 
 
737 aa  303  8.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.28 
 
 
704 aa  302  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  34.49 
 
 
724 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  34.32 
 
 
903 aa  293  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  33.67 
 
 
758 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  32.4 
 
 
734 aa  281  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.9 
 
 
983 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.9 
 
 
983 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.66 
 
 
979 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  31.2 
 
 
854 aa  272  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.62 
 
 
766 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  53.79 
 
 
876 aa  268  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  30.21 
 
 
787 aa  263  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  33.23 
 
 
772 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  33.23 
 
 
772 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  33.23 
 
 
772 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  31.76 
 
 
807 aa  259  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  28.37 
 
 
730 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  28.53 
 
 
730 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  33.12 
 
 
741 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.59 
 
 
741 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  28.37 
 
 
730 aa  258  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  28.37 
 
 
730 aa  258  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  28.37 
 
 
730 aa  258  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  28.37 
 
 
730 aa  258  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  30.97 
 
 
740 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  31.17 
 
 
730 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  33.79 
 
 
784 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  30 
 
 
730 aa  251  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  30.12 
 
 
814 aa  251  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.85 
 
 
1382 aa  251  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  30.5 
 
 
730 aa  251  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  34.58 
 
 
745 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  29.82 
 
 
730 aa  248  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 
787 aa  248  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  30.97 
 
 
958 aa  245  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  35.65 
 
 
743 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.33 
 
 
978 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  31.48 
 
 
843 aa  243  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  29.41 
 
 
738 aa  243  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.36 
 
 
733 aa  241  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  29.86 
 
 
737 aa  240  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  31.53 
 
 
751 aa  240  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31.9 
 
 
968 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  29.88 
 
 
736 aa  236  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  47.5 
 
 
715 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  31.97 
 
 
1092 aa  234  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  33.33 
 
 
966 aa  233  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  28.24 
 
 
846 aa  233  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  27.92 
 
 
710 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  31.35 
 
 
805 aa  228  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  28.22 
 
 
744 aa  227  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  53.12 
 
 
776 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  29.34 
 
 
796 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  29.91 
 
 
729 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  31.21 
 
 
840 aa  223  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  31.42 
 
 
704 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  26.74 
 
 
770 aa  217  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  44.23 
 
 
841 aa  217  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  47.06 
 
 
758 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  29.37 
 
 
1155 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  50.2 
 
 
743 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  47.72 
 
 
718 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.85 
 
 
724 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.25 
 
 
740 aa  210  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  32.72 
 
 
731 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  30.95 
 
 
738 aa  208  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>