250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1152 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  100 
 
 		 382 aa  796    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  43.08 
 
 		 467 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  44.86 
 
 		 432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  37.21 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  42.49 
 
 		 397 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  39.44 
 
 		 415 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  39.44 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  39.04 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  38.75 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  36.06 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  39.32 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  39.08 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  38.98 
 
 		 423 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  37.18 
 
 		 435 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  34.25 
 
 		 410 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  37.96 
 
 		 470 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  37.99 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  36.71 
 
 		 469 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  33.78 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  36.67 
 
 		 449 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  36.67 
 
 		 454 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  34.77 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  33.61 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  36.89 
 
 		 469 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  36.55 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  34.09 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  35.24 
 
 		 384 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  37.4 
 
 		 457 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  36.99 
 
 		 491 aa  230  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  35.87 
 
 		 466 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  38.84 
 
 		 467 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  36.73 
 
 		 452 aa  229  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  34.88 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  35.85 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0919  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.43 
 
 		 398 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  37.28 
 
 		 455 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1734  nitrate transporter, putative  35.24 
 
 		 361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  34.06 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4960  putative nitrate transport protein  34.78 
 
 		 338 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.62 
 
 		 668 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.62 
 
 		 668 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4497  putative nitrate transport protein  34.87 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  33.33 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.58 
 
 		 669 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  33.06 
 
 		 425 aa  202  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.93 
 
 		 385 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  30.46 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3039  putative nitrate transport protein  32.07 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.7 
 
 		 668 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5013  putative nitrate transport protein  33.24 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.826042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  31.3 
 
 		 423 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  35.02 
 
 		 657 aa  196  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  30.46 
 
 		 450 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  32.66 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  32.86 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  30.56 
 
 		 433 aa  192  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  32.57 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  32.57 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  32.57 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  32.57 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  30.87 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  33.8 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  37.77 
 
 		 667 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.27 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  31.4 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  32.29 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4454  putative nitrate transport protein  31.71 
 
 		 390 aa  189  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2301  putative nitrate transport protein  34.01 
 
 		 333 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  32 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  32 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  29.72 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  29.81 
 
 		 457 aa  187  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  29.95 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  31.25 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  28.99 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  30.63 
 
 		 467 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.39 
 
 		 403 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  31.55 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  30.64 
 
 		 456 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  30.79 
 
 		 462 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  29.65 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  30.64 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  31.55 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  27.25 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.73 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  30.63 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.73 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  29.75 
 
 		 442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.97 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  31.48 
 
 		 464 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  32.11 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  30.81 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  30.31 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.83 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  30.08 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  30.87 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  29.75 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  30.77 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  32.3 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.55 
 
 		 673 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>