119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2969 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  795    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  64.78 
 
 		 401 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  52.22 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  41.2 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  40.43 
 
 		 402 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  40.84 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  38.31 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  38.18 
 
 		 399 aa  232  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  40.41 
 
 		 399 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  35.59 
 
 		 403 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  32.43 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 		 914 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  32.01 
 
 		 891 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 		 900 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 		 900 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  31.25 
 
 		 924 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  31.07 
 
 		 926 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  33.84 
 
 		 896 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  33.84 
 
 		 894 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  33.84 
 
 		 904 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.08 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  33.84 
 
 		 904 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  33.84 
 
 		 912 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  25.08 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  25.78 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.11 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  28.26 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.25 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  30.4 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  29.8 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  29.1 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  27.83 
 
 		 756 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  25.58 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.14 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  29.51 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.16 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  28.69 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  27.16 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  24.33 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  24.33 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  24.33 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  28.42 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  25.32 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  26.97 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  25.2 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  27.65 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  26.24 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.64 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.51 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  28.88 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.05 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.05 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  33.81 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.42 
 
 		 723 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.17 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  25.51 
 
 		 575 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  25.58 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  24 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.25 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  26.85 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.77 
 
 		 541 aa  50.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.19 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  28.42 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.79 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2431  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.48 
 
 		 1143 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  24.68 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  30.74 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  31.37 
 
 		 643 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.55 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  25.81 
 
 		 543 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1604  carbamoyl-phosphate synthetase large chain  29.44 
 
 		 668 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0456964  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  29.41 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.5 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1564  biotin carboxylase  24.72 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000326009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.82 
 
 		 1074 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  26.47 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.08 
 
 		 413 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.07 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.07 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  26.92 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  30.49 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1473  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  28.49 
 
 		 666 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  27.62 
 
 		 654 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4048  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  29.46 
 
 		 700 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  29.13 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12823  carbamoyl-phosphate synthase, large (or ammonia) subunit (carB)  25 
 
 		 950 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.188852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  22.41 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1528  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  28 
 
 		 734 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.890646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2084  hypothetical protein  26.63 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0903485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4726  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  26.82 
 
 		 675 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248111  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  24.58 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  29.13 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2581  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.89 
 
 		 1109 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2449  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.67 
 
 		 1154 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.060664  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2124  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  29.82 
 
 		 666 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494302  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1716  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  27.84 
 
 		 447 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0345  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  26.12 
 
 		 665 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780411 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0761  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  27.12 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0872  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.38 
 
 		 1075 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.37 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>