More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2770 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 187 aa  174  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 207 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  41.94 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  41.94 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  42.16 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  42.16 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  34.76 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 224 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 190 aa  111  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 192 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  35.33 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  35.33 
 
 		 260 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  39.67 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 216 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  33.16 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.15 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  38.15 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  34.41 
 
 		 212 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  36.99 
 
 		 189 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 182 aa  94.4  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 259 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 248 aa  91.3  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 186 aa  90.9  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3188  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  27.96 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  31.28 
 
 		 191 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2607  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2743  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  35.39 
 
 		 229 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0594  DNA-binding protein  34.32 
 
 		 219 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 229 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2078  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  34.1 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  34.1 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6018  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  34.1 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0229  DNA-binding protein  34.32 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2441  DNA-binding protein  34.32 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2717  DNA-binding protein  34.32 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2361  DNA-binding protein  34.32 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  27.68 
 
 		 182 aa  87.8  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  27.87 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  27.87 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  27.42 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  27.87 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 206 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  27.96 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  28.34 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0608  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  30.98 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 203 aa  84.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  34.08 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  33.52 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  32.57 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>