69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1759 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  74.49 
 
 		 215 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2870  transcriptional regulator, TetR family  68.21 
 
 		 197 aa  268  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0570859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 200 aa  246  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2164  transcriptional regulator, TetR family  66.33 
 
 		 199 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  0.0672199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5295  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 189 aa  208  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2383  transcriptional regulator, TetR family  56.54 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5342  putative transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.744613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 141 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  47.27 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  43.28 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 233 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  27.94 
 
 		 194 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 242 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 209 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 225 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  34.48 
 
 		 193 aa  42  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 227 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 428 aa  42  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 168 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>