287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1492 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 
252 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  75.96 
 
 
185 aa  274  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  70.53 
 
 
196 aa  251  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  70.86 
 
 
193 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0975  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  72 
 
 
224 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0643579  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  67.63 
 
 
282 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  67.05 
 
 
191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.3 
 
 
320 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  65.73 
 
 
241 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  67.65 
 
 
220 aa  222  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  64.57 
 
 
261 aa  221  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  63.48 
 
 
205 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.07 
 
 
205 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  62.57 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  54.55 
 
 
221 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1929  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  66.86 
 
 
224 aa  214  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.86 
 
 
279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  63.64 
 
 
224 aa  207  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1533  putative transcriptional regulator  53.66 
 
 
229 aa  208  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00325618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  60.22 
 
 
231 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  60.22 
 
 
231 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  67.28 
 
 
253 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  60.22 
 
 
231 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  56.52 
 
 
252 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  57.06 
 
 
193 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5062  segregation and condensation protein B  62.8 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10845  normal  0.0370929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  54.81 
 
 
243 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  61.63 
 
 
191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  63.58 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  60.45 
 
 
241 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  57.71 
 
 
231 aa  189  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1563  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  61.9 
 
 
254 aa  185  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  53.07 
 
 
238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.28 
 
 
208 aa  171  9e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  58.23 
 
 
237 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.7 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  48.52 
 
 
269 aa  154  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  41.24 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  42.77 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.67 
 
 
187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  43.5 
 
 
195 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  44.85 
 
 
353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  41.1 
 
 
171 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  44.51 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  46.01 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  46.71 
 
 
184 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.67 
 
 
189 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.65 
 
 
193 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  35.93 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  38.04 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  38.04 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  38.04 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  38.04 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  38.04 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  38.04 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  43.03 
 
 
181 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  37.42 
 
 
190 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  34.16 
 
 
183 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  37.42 
 
 
190 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  37.71 
 
 
352 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  41.46 
 
 
299 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  34.86 
 
 
179 aa  111  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 
185 aa  111  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  36.81 
 
 
190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.04 
 
 
192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.58 
 
 
387 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  38.04 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  37.58 
 
 
372 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  37.58 
 
 
387 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.31 
 
 
196 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.36 
 
 
197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  37.04 
 
 
190 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 
212 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.16 
 
 
534 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.18 
 
 
200 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  39.63 
 
 
195 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 
190 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  38.01 
 
 
273 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  40.96 
 
 
221 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  45.89 
 
 
210 aa  106  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.33 
 
 
179 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  35.36 
 
 
206 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  29.12 
 
 
237 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  36.2 
 
 
190 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  32.76 
 
 
198 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  36.59 
 
 
206 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  39.39 
 
 
178 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 
455 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  41.01 
 
 
194 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  32.72 
 
 
180 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 
442 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 
456 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 
442 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 
458 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 
442 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 
442 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  39.16 
 
 
456 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.9 
 
 
176 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  37.93 
 
 
184 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>