74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1250 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 410 aa  784    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  54.69 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  48.3 
 
 		 404 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 1019 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 449 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  41.98 
 
 		 420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  44.01 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 430 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  38.46 
 
 		 467 aa  125  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  31.41 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 446 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 397 aa  90.1  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  27.93 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  25.82 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  28.21 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  26.3 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  26.33 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  26.05 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  26.05 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  24.15 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  28.88 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  30.91 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  22.64 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  25.81 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  26.14 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  25.19 
 
 		 424 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 461 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  26.85 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  26.43 
 
 		 481 aa  43.9  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.4 
 
 		 1833 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>