205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0779 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  323  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  43.97 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  38.81 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  46.53 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  35.14 
 
 		 154 aa  87.8  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  37.24 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  39.5 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  31.4 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  30.2 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  24.44 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  24.44 
 
 		 190 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.11 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  31.33 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  28.8 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>