116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2029 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 161 aa  307  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  39.74 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  38.36 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  35.44 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  39.87 
 
 		 225 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  35.03 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  33.74 
 
 		 216 aa  92.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  36.94 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  38.03 
 
 		 187 aa  90.9  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  38.41 
 
 		 185 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 238 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  40.29 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  36.54 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  34.38 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  33.77 
 
 		 199 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.01 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  41.04 
 
 		 169 aa  85.1  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  38.52 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  31.71 
 
 		 244 aa  84.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  36.67 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.32 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  36.81 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  30.34 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  41.55 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  33.33 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.29 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  33.82 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  34.78 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  35.23 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.95 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.29 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  35.54 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  34.57 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  31.51 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  41.88 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  36.02 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  30.83 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  35.71 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  34.9 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  34.9 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  33.58 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  32.05 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  25.61 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  38.78 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  33.91 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  35.42 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  30.98 
 
 		 180 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  32.89 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  30.39 
 
 		 187 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  28.4 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  31.14 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  32.24 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  33.15 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  34.33 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  30.52 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  39.29 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  30.54 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  31.93 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  34.42 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  29.8 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  35 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  30.63 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  32.35 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  34.25 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  34.01 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  27.27 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  30.87 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  34.93 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.7 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  32.35 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  29.89 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  35.12 
 
 		 301 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  33.12 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  32.08 
 
 		 241 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  33.91 
 
 		 227 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  26.22 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  33.71 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  33.57 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  33.93 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  27.7 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.69 
 
 		 221 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  32.53 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.24 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2368  nuclease (SNase domain protein)  47.06 
 
 		 122 aa  47.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  26.29 
 
 		 187 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  32.67 
 
 		 242 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  34.75 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  32.8 
 
 		 266 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  33.12 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  27.45 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  35.44 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  31.33 
 
 		 242 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  31.68 
 
 		 212 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.87 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  25.66 
 
 		 189 aa  44.7  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  26.67 
 
 		 193 aa  44.3  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  35.88 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  26.14 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  24.43 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>