40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2368 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011061  Paes_2368  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 122 aa  254  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  42.64 
 
 		 238 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  38.33 
 
 		 244 aa  103  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.87 
 
 		 232 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0502  hypothetical protein  44.78 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  50.94 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  53.06 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  39.06 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  48 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1415  hypothetical protein  44.68 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  58.33 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  40.82 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  38 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  38 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  36.73 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  34.69 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  37.93 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  42.22 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  38.46 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  38.46 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  42.11 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  42.31 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  42.11 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  35.94 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  35.29 
 
 		 227 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  36.54 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  32.76 
 
 		 171 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  38.46 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  30.1 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  40.38 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  38 
 
 		 192 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  37.04 
 
 		 225 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 206 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.71 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  33.33 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  30 
 
 		 390 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 		 226 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  35.29 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  40.38 
 
 		 187 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>