199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2853 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  56 
 
 		 198 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  52.28 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  52.2 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  51.71 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  45.73 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  46.38 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  34.65 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  37.62 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  34.27 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  38.24 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  34.36 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  46.55 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  41.59 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  36.18 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  43.64 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  35.18 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  39.67 
 
 		 213 aa  84.3  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  34.2 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  40.17 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  39.82 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  38.05 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  32.84 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  44.66 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  33.85 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  38.94 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  47.62 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  44.66 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  32.18 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  33.33 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  37.84 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  33.33 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  36.51 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  36.28 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  42.61 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  44.74 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  39.47 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  35.4 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  25.13 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  39.05 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  36.04 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  29.46 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  37.96 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  42.16 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  34.82 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  37.84 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  38.1 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  37.04 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  29.73 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  41.51 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  35.24 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  29.5 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  36.94 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  35.24 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  30.73 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  37.61 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  33.33 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  34.26 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  37.27 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  34.26 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  34.26 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  29.09 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  37.27 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  36.19 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  35.14 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  37.27 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  31.18 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  37.27 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  36.7 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  29.81 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  43 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  43 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  36.21 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  33.03 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  32.11 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  31.18 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  31.86 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  32.71 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  38.1 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  32.71 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  32.71 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  32.71 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  32.71 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  35.78 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  32.71 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  32.74 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  35.45 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  35.45 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  35.19 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  36.36 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  30.48 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  37.27 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  26.87 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  37.38 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  35.45 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2895  Smr protein/MutS2  33.04 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  30.09 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  29.73 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>