227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3162 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 450 aa  905    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  66.81 
 
 		 225 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  62.27 
 
 		 313 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  62.5 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  56.35 
 
 		 275 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  44.95 
 
 		 232 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  38.12 
 
 		 253 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  48.09 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  47.33 
 
 		 221 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  47.33 
 
 		 221 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  41.24 
 
 		 180 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  45.22 
 
 		 196 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  35.48 
 
 		 197 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  35.59 
 
 		 224 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  43.09 
 
 		 223 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  40.22 
 
 		 178 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  36.32 
 
 		 292 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  38.27 
 
 		 247 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  36.72 
 
 		 259 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  30.29 
 
 		 256 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  36 
 
 		 221 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  36 
 
 		 221 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  33.52 
 
 		 213 aa  89.7  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  42.54 
 
 		 234 aa  90.1  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  38.93 
 
 		 182 aa  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  39.89 
 
 		 227 aa  89.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  39.43 
 
 		 245 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  39.43 
 
 		 245 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  39.43 
 
 		 245 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  44.23 
 
 		 218 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  39.43 
 
 		 245 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  39.43 
 
 		 245 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  39.43 
 
 		 245 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  39.43 
 
 		 245 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  36.21 
 
 		 259 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  45.53 
 
 		 221 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  36.21 
 
 		 259 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  36.21 
 
 		 259 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  42.98 
 
 		 299 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  42.98 
 
 		 252 aa  87.4  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  40.52 
 
 		 221 aa  86.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  33.86 
 
 		 198 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  38.84 
 
 		 198 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  41.03 
 
 		 278 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  46.67 
 
 		 230 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  46.67 
 
 		 219 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  46.67 
 
 		 227 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  35.88 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  43.52 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  35.35 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  43.48 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  42.74 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  37.1 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  39.29 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  42.57 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  39.82 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  32.62 
 
 		 196 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  43.69 
 
 		 196 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  36.52 
 
 		 203 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  34.62 
 
 		 186 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  40.18 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  39.45 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  31.32 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  41.24 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1820  Smr protein/MutS2  31.87 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  34.38 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  32.81 
 
 		 187 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  35.08 
 
 		 205 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  32.09 
 
 		 196 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  41.58 
 
 		 180 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  32.81 
 
 		 187 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  32.09 
 
 		 196 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  37.38 
 
 		 166 aa  75.1  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2096  Smr protein/MutS2  30.69 
 
 		 188 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  37.84 
 
 		 205 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  32.09 
 
 		 213 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  40 
 
 		 200 aa  75.5  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  32.6 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  32.29 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  32.29 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  32.29 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  29.2 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  31.55 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  32.29 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  38.68 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  38.68 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  39.05 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  38.1 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1782  Smr domain-containing protein  32.29 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  30.73 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1585  Smr domain protein  32.29 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  39.22 
 
 		 198 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  32.98 
 
 		 233 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  37.93 
 
 		 211 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1457  Smr domain-containing protein  31.77 
 
 		 187 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  39.22 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  38.24 
 
 		 196 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  42.86 
 
 		 178 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  37.74 
 
 		 196 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  29.47 
 
 		 193 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>