233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4533 on replicon NC_009035
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  100 
 
 
213 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  99.49 
 
 
196 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  98.98 
 
 
196 aa  400  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  98.98 
 
 
196 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  84.69 
 
 
196 aa  345  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  84.69 
 
 
196 aa  344  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  84.18 
 
 
196 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  81.63 
 
 
196 aa  331  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  85.2 
 
 
196 aa  325  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1886  Smr protein/MutS2  47.98 
 
 
200 aa  195  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  45.92 
 
 
196 aa  184  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  44.9 
 
 
196 aa  177  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2054  Smr protein/MutS2  43.75 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1818  Smr domain-containing protein  44.21 
 
 
218 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3112  Smr protein/MutS2  42.41 
 
 
194 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01397  Smr domain (Small MutS Related) containing protein  36.55 
 
 
195 aa  135  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  39.13 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  39.09 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  36.79 
 
 
193 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  38.66 
 
 
193 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  45.38 
 
 
192 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  37.11 
 
 
193 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  38.78 
 
 
190 aa  118  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  35.43 
 
 
181 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1782  Smr domain-containing protein  35.11 
 
 
187 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1585  Smr domain protein  36.32 
 
 
187 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  36.57 
 
 
178 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  35.11 
 
 
187 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  35.11 
 
 
187 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  35.11 
 
 
187 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  35.11 
 
 
187 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  34.57 
 
 
187 aa  104  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  34.57 
 
 
187 aa  104  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  34.57 
 
 
187 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  34.57 
 
 
187 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  34.57 
 
 
187 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  34.57 
 
 
187 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  34.57 
 
 
187 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1457  Smr domain-containing protein  34.57 
 
 
187 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1820  Smr protein/MutS2  32.98 
 
 
188 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  37.14 
 
 
179 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  31.12 
 
 
189 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  33.15 
 
 
185 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  45.13 
 
 
217 aa  97.8  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  31.52 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  34.64 
 
 
185 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  35.23 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  35.03 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  35.76 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  30.41 
 
 
190 aa  94.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  41.82 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  42.61 
 
 
226 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  33.15 
 
 
226 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2096  Smr protein/MutS2  29.74 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  35.37 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  31.11 
 
 
186 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  42.73 
 
 
219 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  35.59 
 
 
227 aa  92  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  35.26 
 
 
234 aa  92  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  40.91 
 
 
223 aa  91.3  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1857  Smr protein/MutS2  31.09 
 
 
187 aa  91.7  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  34.39 
 
 
221 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  33.9 
 
 
219 aa  91.3  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  39.09 
 
 
221 aa  91.3  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  34.39 
 
 
221 aa  91.3  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  41.07 
 
 
221 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  31.67 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  35.59 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  31.11 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  40.54 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  31.67 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  31.91 
 
 
242 aa  88.2  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  34.46 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  34.08 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  30.56 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  31.28 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  31.67 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  29.71 
 
 
180 aa  85.9  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1893  Smr protein/MutS2  36.52 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  33.91 
 
 
266 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  31.84 
 
 
186 aa  85.5  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  31.11 
 
 
185 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  37.17 
 
 
245 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  37.17 
 
 
245 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  37.17 
 
 
247 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  31.4 
 
 
292 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  37.17 
 
 
245 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  37.17 
 
 
245 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  37.17 
 
 
245 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  37.17 
 
 
245 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  37.17 
 
 
245 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  30.23 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  29.61 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  29.19 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  30.23 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  30.23 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  30.23 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  30.22 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  30.22 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>