197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0952 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  339  1e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  50.81 
 
 
204 aa  130  9e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  52.17 
 
 
189 aa  120  9e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  44.92 
 
 
369 aa  93.2  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  36.7 
 
 
196 aa  87.4  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  29.76 
 
 
275 aa  87.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  29.37 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  30.77 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  32.08 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  31.4 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  35.24 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  31.13 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  27.63 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  27.63 
 
 
198 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  37.62 
 
 
253 aa  79  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  30.4 
 
 
198 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  31.82 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  25.86 
 
 
200 aa  77.4  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  36.19 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  30.82 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  25.29 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  37.38 
 
 
450 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  31.82 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  32.08 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  30.56 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  31.82 
 
 
196 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  29.57 
 
 
211 aa  72  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  33.96 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  31 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  28.99 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  33.96 
 
 
221 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  33.96 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  35.64 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  28.44 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  30.34 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  30.77 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  37.38 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  28.44 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  29.29 
 
 
262 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  42.7 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  34.45 
 
 
266 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  41.57 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  34.45 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  27.84 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  34.69 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  30 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  29.29 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  39.42 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  32.38 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  30.84 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  40.21 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  35.64 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  26.17 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  35.78 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  28.28 
 
 
261 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  28.97 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  28.28 
 
 
256 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  34.62 
 
 
234 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  35.05 
 
 
226 aa  63.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  34.78 
 
 
239 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  36.08 
 
 
227 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  29.51 
 
 
198 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  36.08 
 
 
234 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4124  Smr protein/MutS2  32.63 
 
 
209 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  35.24 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  35.05 
 
 
230 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  37 
 
 
186 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  36.73 
 
 
192 aa  62  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  31.88 
 
 
186 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  29.19 
 
 
211 aa  62  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  31.73 
 
 
240 aa  62  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 
193 aa  62  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  37 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  28.69 
 
 
197 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  31.09 
 
 
221 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  31.09 
 
 
221 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  35.51 
 
 
236 aa  61.6  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  25.45 
 
 
192 aa  61.2  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  32.38 
 
 
364 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  32.65 
 
 
196 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  31.03 
 
 
217 aa  61.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  25.69 
 
 
173 aa  60.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  34 
 
 
182 aa  60.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  31.63 
 
 
196 aa  60.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  31.63 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  32.71 
 
 
256 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  27.01 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1886  Smr protein/MutS2  34.02 
 
 
200 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  35.35 
 
 
213 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  30.39 
 
 
213 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  35 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  38 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  30.39 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  31.63 
 
 
196 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  30.39 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  30.39 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>