197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1246 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  45.97 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  44.28 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  43.33 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  40.31 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  41.24 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  41.24 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  42.16 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  39.32 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  37.85 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  39.9 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  39.7 
 
 		 180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  47.58 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  37.05 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  37 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  39.39 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  36.82 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  37.37 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  36.84 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  36.67 
 
 		 198 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  37.56 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  35.79 
 
 		 179 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  40.65 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  31.75 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  32.82 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  35.94 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  36.32 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  37.25 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  34.45 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  44.72 
 
 		 185 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  34.52 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  33.17 
 
 		 197 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  45.79 
 
 		 262 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  31.4 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  37.1 
 
 		 450 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  31.31 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  36.29 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  45.79 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  45.79 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  39.17 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  39.02 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  30.65 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  37.7 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  37.7 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  31.25 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  36.89 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  37.7 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  32.84 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  34.43 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  27.05 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  31.63 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  30.37 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  27.23 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  22.86 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  34.51 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  30.43 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  32.41 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  31.72 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  38.52 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  33.87 
 
 		 364 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  27.23 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  25.98 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  32.79 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  31.03 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  32.79 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  26.47 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  39.23 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  32.79 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  32.79 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  32.79 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  33.9 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  29.59 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  35 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  29.5 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  29.5 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  31.82 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  34.78 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  33.87 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  29.51 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  35.29 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  35.66 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  32.77 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  25.89 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  25.89 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  25.89 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  32.77 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  25.89 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  25.89 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  34.45 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  25.89 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  25.89 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1782  Smr domain-containing protein  26.4 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1585  Smr domain protein  26.4 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  25.89 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  25.89 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  25.89 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  25.89 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  33.33 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  32.5 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>