231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0545 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  44.26 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  45.09 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  43.26 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  45.3 
 
 		 219 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  40.41 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  43.86 
 
 		 179 aa  131  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  41.49 
 
 		 259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  41.81 
 
 		 245 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  41.81 
 
 		 245 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  41.81 
 
 		 245 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  41.81 
 
 		 245 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  41.81 
 
 		 245 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  41.81 
 
 		 245 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  41.81 
 
 		 245 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  41.57 
 
 		 292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  41.57 
 
 		 252 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  41.76 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  41.01 
 
 		 299 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  40.7 
 
 		 180 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  39.23 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  39.23 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  39.23 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  37.84 
 
 		 217 aa  121  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  40.46 
 
 		 266 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  40.33 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  38.38 
 
 		 278 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  40.12 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  57.89 
 
 		 178 aa  117  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  38.62 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  41.18 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  35.91 
 
 		 242 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  38.46 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  45.53 
 
 		 221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  46.34 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  46.34 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  37.06 
 
 		 256 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  41.07 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  40.35 
 
 		 230 aa  111  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  42.35 
 
 		 234 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  37.65 
 
 		 224 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  41.38 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  37.28 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  36.87 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  36.31 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  37.29 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  35.71 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  35.16 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  40.7 
 
 		 226 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  43.41 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  34.62 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  39.41 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  39.41 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  38.51 
 
 		 221 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  34.62 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  35 
 
 		 368 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  34.43 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  34.44 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  52.17 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  35.75 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  34.97 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  37.76 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  34.44 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  39.68 
 
 		 243 aa  101  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  35.36 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  40.62 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  34.43 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  39.68 
 
 		 257 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  40.48 
 
 		 257 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  33.88 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  42.37 
 
 		 213 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  33.91 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  33.91 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  33.91 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  33.91 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  33.91 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  49.5 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  38.41 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  35.2 
 
 		 205 aa  94.4  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  30.56 
 
 		 193 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  32.2 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1782  Smr domain-containing protein  33.33 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  32.2 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1585  Smr domain protein  33.33 
 
 		 187 aa  91.7  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  33.33 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  33.33 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  39.45 
 
 		 196 aa  89  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1457  Smr domain-containing protein  32.76 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  31.25 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  31.11 
 
 		 196 aa  88.2  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  29.83 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  37.61 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  43.56 
 
 		 221 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  31.28 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  30.65 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>