233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1830 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  100 
 
 
178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  55.88 
 
 
178 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  50.57 
 
 
182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  50 
 
 
186 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  59.3 
 
 
189 aa  159  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  48.55 
 
 
179 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  55.09 
 
 
219 aa  148  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  48.54 
 
 
211 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  45.4 
 
 
186 aa  137  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  48.5 
 
 
292 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  46.71 
 
 
259 aa  131  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  45.51 
 
 
278 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  45.51 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  45.51 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  45.51 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  46.11 
 
 
245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  46.11 
 
 
245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  46.11 
 
 
245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  46.11 
 
 
245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  46.11 
 
 
245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  46.11 
 
 
245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  46.11 
 
 
245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  46.11 
 
 
247 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  44.31 
 
 
266 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  45.45 
 
 
181 aa  127  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  38.86 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  45.62 
 
 
259 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  45.61 
 
 
256 aa  124  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  46.99 
 
 
234 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  42.29 
 
 
185 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  41.67 
 
 
217 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  41.76 
 
 
218 aa  121  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  39.66 
 
 
185 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  47.9 
 
 
299 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  40.8 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  37.29 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  37.85 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  40.91 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  37.29 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  47.9 
 
 
252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  37.71 
 
 
185 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  44.58 
 
 
226 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  42.51 
 
 
223 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  43.11 
 
 
221 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  43.11 
 
 
221 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  45.64 
 
 
221 aa  117  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  41.14 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  42.51 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  36.72 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  43.27 
 
 
230 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  41.1 
 
 
368 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  41.92 
 
 
221 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  42.2 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  43.27 
 
 
227 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  43.35 
 
 
179 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  41.76 
 
 
227 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  35.14 
 
 
242 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  48.53 
 
 
192 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  48.53 
 
 
192 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  37.64 
 
 
189 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  44.36 
 
 
219 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  36.52 
 
 
189 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  43.18 
 
 
179 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  32.95 
 
 
199 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  42.65 
 
 
226 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  39.34 
 
 
205 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  38.33 
 
 
197 aa  98.6  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  32.37 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  40.35 
 
 
180 aa  97.4  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  36.26 
 
 
270 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  36.26 
 
 
221 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  35.98 
 
 
253 aa  95.9  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  35.47 
 
 
313 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  32.39 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  36.99 
 
 
196 aa  94.4  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  41.73 
 
 
221 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  32.42 
 
 
193 aa  94.4  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  36.42 
 
 
196 aa  94  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  34.83 
 
 
225 aa  94.4  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  36.56 
 
 
450 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  36.42 
 
 
196 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  35.03 
 
 
196 aa  91.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  35.84 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  37.64 
 
 
275 aa  89.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  38.51 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  35.84 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  35.84 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  32.95 
 
 
190 aa  89  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  42.06 
 
 
257 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  36.36 
 
 
193 aa  89  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  39.29 
 
 
243 aa  89.4  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  35.8 
 
 
364 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  35.84 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  42.99 
 
 
257 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  38.39 
 
 
243 aa  88.2  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  35.93 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  35.93 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  35.93 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  35.93 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  35.26 
 
 
196 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>