238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0544 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 192 aa  374  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  100 
 
 		 192 aa  374  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  45.98 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  46.86 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  42.49 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  48 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  46.96 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  46.15 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  50.34 
 
 		 227 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  44.38 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  44.97 
 
 		 292 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  43.79 
 
 		 259 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  42.29 
 
 		 182 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  43.79 
 
 		 259 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  43.79 
 
 		 259 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  43.79 
 
 		 278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  43 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  43.79 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  42.35 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  42.94 
 
 		 223 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  46.58 
 
 		 221 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  46.58 
 
 		 221 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  49.66 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  40 
 
 		 247 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  46.67 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  41.72 
 
 		 259 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  44.05 
 
 		 178 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  46.15 
 
 		 299 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  46.15 
 
 		 252 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  44.9 
 
 		 221 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  42.42 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  42.42 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  42.42 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  42.42 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  42.42 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  42.42 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  42.42 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  40.91 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  45.66 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  42.47 
 
 		 224 aa  117  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  42.94 
 
 		 368 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  47.1 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  47.41 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  38.64 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  40.59 
 
 		 181 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  41.86 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  41.52 
 
 		 179 aa  104  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  38.86 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  34.24 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  47.67 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  41.77 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  37.36 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  47.37 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  44.29 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  41.07 
 
 		 243 aa  92  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  38.14 
 
 		 243 aa  91.7  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  46.36 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  34.55 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  47.9 
 
 		 178 aa  87.8  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  39.57 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  39.32 
 
 		 257 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  38.46 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  38.46 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  38.46 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1539  Smr protein/MutS2  31.49 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  30.64 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2595  hypothetical protein  35.16 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  44.79 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  37.7 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  34.07 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  35.4 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  30.23 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1343  hypothetical protein  38.16 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  30.81 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  30.77 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  30.22 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  32.95 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02757  Smr protein/MutS2  41.67 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0356192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  30.64 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  35 
 
 		 275 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1451  hypothetical protein  38.35 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.730382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2813  hypothetical protein  38.35 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3472  hypothetical protein  32.42 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  36.07 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  31.98 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  31.79 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  32.07 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  31.21 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  36.07 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  31.98 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  36.89 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  31.98 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  31.98 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  31.18 
 
 		 313 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2879  hypothetical protein  30.39 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0178809  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  36.89 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  38.53 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1325  Smr protein/MutS2  31.49 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2483  hypothetical protein  31.49 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2626  hypothetical protein  31.49 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>