258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0683 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  100 
 
 
224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  77.68 
 
 
223 aa  337  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  69.81 
 
 
221 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  70.75 
 
 
221 aa  271  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  69.34 
 
 
221 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  56.59 
 
 
292 aa  225  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  53.17 
 
 
278 aa  222  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  54.11 
 
 
259 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  54.11 
 
 
247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  54.11 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  54.11 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  53.66 
 
 
259 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  50.24 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  54.03 
 
 
234 aa  208  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  54.5 
 
 
218 aa  207  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  54.82 
 
 
266 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  52.53 
 
 
259 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  53.37 
 
 
227 aa  203  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  52.36 
 
 
221 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  58.88 
 
 
299 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  59.9 
 
 
252 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  54.68 
 
 
230 aa  198  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  58.86 
 
 
227 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  54.15 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  54.15 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  54.15 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  54.15 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  54.15 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  54.15 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  54.15 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  55.07 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  59.41 
 
 
226 aa  188  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  56.02 
 
 
226 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  43.5 
 
 
256 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  44.77 
 
 
179 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  45.51 
 
 
219 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  45.51 
 
 
368 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  40.19 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  39.52 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  40.46 
 
 
178 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  48.76 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  36.22 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  38.42 
 
 
186 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  49.59 
 
 
221 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  49.59 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  41.84 
 
 
192 aa  111  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  41.84 
 
 
192 aa  111  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  47.93 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  33.62 
 
 
364 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  34.27 
 
 
199 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  33.71 
 
 
180 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  31.73 
 
 
450 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1343  hypothetical protein  35.39 
 
 
181 aa  99  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  36.98 
 
 
253 aa  98.6  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  35.63 
 
 
181 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 
189 aa  96.3  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  34.66 
 
 
189 aa  96.3  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  34.43 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2595  hypothetical protein  34.48 
 
 
180 aa  95.5  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  34.09 
 
 
189 aa  95.1  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  33.52 
 
 
177 aa  95.1  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  41.82 
 
 
213 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  41.82 
 
 
196 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  28.5 
 
 
242 aa  94.7  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2813  hypothetical protein  34.3 
 
 
180 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  41.82 
 
 
196 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  41.82 
 
 
196 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1451  hypothetical protein  34.3 
 
 
180 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.730382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  40.91 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  33.7 
 
 
185 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  35.26 
 
 
196 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  33.64 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  30.9 
 
 
186 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  54.65 
 
 
178 aa  91.3  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  34.59 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  34.68 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  34.68 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  30.73 
 
 
186 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  36.84 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3472  hypothetical protein  32.95 
 
 
183 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  40.83 
 
 
197 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  39.37 
 
 
185 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  33.73 
 
 
196 aa  89.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0379  hypothetical protein  34.34 
 
 
176 aa  89  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1403  hypothetical protein  34.34 
 
 
176 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  33.83 
 
 
186 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  33.01 
 
 
232 aa  88.6  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  30.43 
 
 
213 aa  89  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  33.49 
 
 
313 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  30 
 
 
186 aa  88.6  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1325  Smr protein/MutS2  32.37 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2709  hypothetical protein  32.37 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02216  hypothetical protein  32.37 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2626  hypothetical protein  32.37 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2488  hypothetical protein  32.37 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00371874  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2483  hypothetical protein  32.37 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  38.79 
 
 
190 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1512  hypothetical protein  34.34 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  33.92 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1321  hypothetical protein  32.37 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>