215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3896 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  62.39 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  61.57 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  50.21 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  51.28 
 
 		 242 aa  207  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  50 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  47.37 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  37.92 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  38.71 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  39.34 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  38.29 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  41.14 
 
 		 299 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  38.29 
 
 		 266 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  41.14 
 
 		 252 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  37.71 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  38.98 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  37.5 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  37.14 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  37.14 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  37.14 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  35.59 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  49.48 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  34.81 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  34.38 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  37.5 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  40.48 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  41.94 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  36.57 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  35.43 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  36.99 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  36.99 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  36.99 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  36.99 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  36.99 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  36.99 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  36.99 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  37.11 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  36 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  38.07 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  41.33 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  38.27 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1886  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  37.5 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  34.39 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  32.07 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  39.57 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  39.57 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  37.74 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  36.94 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  39.86 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  34.19 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  31.38 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  31.75 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  37.65 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  33.52 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  33.91 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  38.93 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  41.07 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  37.65 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  36.04 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  37.25 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  36.6 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  37.4 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  32.53 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  34.24 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  39.71 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  45.88 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  43.69 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  29.74 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  40.4 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  30.56 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  28.42 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  28.88 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  28.88 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1865  Smr protein/MutS2  40.48 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00151005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  39.81 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  36 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  30.61 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  34.62 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  28.34 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  38.46 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  36 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  38.46 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  30.65 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  38.32 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  37.25 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  28.21 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  43.24 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2054  Smr protein/MutS2  29.9 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  38.46 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  32 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  36.54 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  40.2 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  31.12 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  37.01 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  39.42 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  38.14 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  35.65 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  27.75 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  33.7 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>