179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0797 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  376  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  62.87 
 
 
204 aa  227  9e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  55.24 
 
 
166 aa  120  9e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  29.61 
 
 
203 aa  91.3  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  34.87 
 
 
369 aa  84.3  8e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  24.74 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  25.77 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  27.42 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  23.63 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  25.26 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  25.64 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  27.2 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  25.54 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  29.66 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  23.81 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  26.26 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  25 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  27.12 
 
 
211 aa  72  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  34.19 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  22.04 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  20.94 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  23.3 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  31.43 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  26.61 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  27.27 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  28.57 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  22.17 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  26.36 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  22.75 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  27.27 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  27.32 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  26.89 
 
 
232 aa  67.8  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  23.2 
 
 
202 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  23.86 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  29.91 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  23.33 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  29.36 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  29.73 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  23.58 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  28.28 
 
 
262 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  29.52 
 
 
450 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  25.45 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1886  Smr protein/MutS2  30 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  37.14 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  31.07 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  29.13 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  25.45 
 
 
270 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  25.42 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  32.38 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  22.41 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  25.45 
 
 
221 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  26.85 
 
 
198 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  31.54 
 
 
196 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  32.74 
 
 
193 aa  61.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  30 
 
 
196 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  23.3 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  27.2 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  31.13 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  23.81 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  34.55 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  26.23 
 
 
173 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  30 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  27.43 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  31.48 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  27.43 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  31.86 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  27.43 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  27.43 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  27.43 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  34.95 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  28.87 
 
 
313 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  29.91 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  31.68 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  35.64 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  29.52 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  33.98 
 
 
236 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  27.27 
 
 
261 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  27.27 
 
 
256 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  28.85 
 
 
233 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  28.44 
 
 
239 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1820  Smr protein/MutS2  30.69 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2096  Smr protein/MutS2  29.7 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  27.36 
 
 
227 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  21.35 
 
 
234 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4124  Smr protein/MutS2  25.62 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  27.27 
 
 
226 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  28.16 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  27.36 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  24.43 
 
 
292 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  23.46 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  31.37 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  21.43 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  23.46 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  26.53 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  26.67 
 
 
211 aa  52  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2054  Smr protein/MutS2  28 
 
 
196 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  29.63 
 
 
224 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  30.09 
 
 
196 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  29.13 
 
 
242 aa  51.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  22.49 
 
 
299 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.407236 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>