110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0582 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 190 aa  360  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  49.21 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  49.62 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  34.36 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  34.36 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  34.8 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  31.37 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  34.01 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  30.43 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  31.5 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  31.53 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  28.71 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  32.43 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  29.53 
 
 		 369 aa  67.8  0.00000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  31.25 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  30.94 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  30.94 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  31.5 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  35.59 
 
 		 450 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  34.75 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  31.94 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  34.21 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  29.95 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  31.91 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  28.85 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  31.68 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  24.32 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  32.97 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  31.12 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  30.22 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  30.73 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  22.28 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  31.86 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  26.98 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  29.08 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  26.98 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  29.08 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1820  Smr protein/MutS2  26.88 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  34.17 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  32.16 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  32.8 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  30.73 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2096  Smr protein/MutS2  25.26 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  36.45 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  26.78 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  25 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  30.57 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  27.84 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  33.93 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  29.95 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  31.78 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  33.93 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  33.04 
 
 		 270 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  26.51 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  30.36 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  32.48 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  30.36 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  28.36 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  23.16 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  23.4 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  23.04 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  28.7 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  27.95 
 
 		 234 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1782  Smr domain-containing protein  30.89 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  31.86 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  30.89 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  30.89 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  30.89 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  30.48 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  30.17 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  30.08 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  30.89 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  30.08 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  31.82 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  29.52 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  35.19 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1585  Smr domain protein  30.89 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  28.57 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  29.2 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  33.01 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  26.6 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  30.17 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  27.68 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  31.3 
 
 		 299 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  35.05 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  30.48 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  32.11 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  31.3 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  28.76 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1457  Smr domain-containing protein  30.08 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  25.75 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  30.48 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1818  Smr domain-containing protein  31.03 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  27.69 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  30.48 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  33.01 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  28.18 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  29.27 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  29.27 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>