206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3487 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 180 aa  356  9e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  51.14 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  51.7 
 
 		 205 aa  157  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  51.14 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  48.39 
 
 		 191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  44.97 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  43.39 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  43.43 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  37.62 
 
 		 203 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  45.21 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  41.26 
 
 		 211 aa  120  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  42.55 
 
 		 198 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  43.26 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  45.11 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  41.67 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  41.33 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  40.11 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  39.27 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  37.06 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  40 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  38.01 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  41.67 
 
 		 185 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  35.68 
 
 		 198 aa  97.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  35.68 
 
 		 198 aa  97.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  36.89 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  50.41 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  54.46 
 
 		 262 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  38.54 
 
 		 211 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  37.88 
 
 		 197 aa  93.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  55.45 
 
 		 256 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  44.74 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  38.8 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  54.46 
 
 		 261 aa  92  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  36.87 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  34.25 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  39.53 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  40.91 
 
 		 450 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  26.32 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  22.75 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  33.16 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  23.3 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  36.45 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  35.78 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  43.93 
 
 		 221 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  43.93 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  43.93 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  42.06 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  36.84 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  36.7 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  34.65 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  35.45 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  32.32 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  33 
 
 		 213 aa  62  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  41.41 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  41.24 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  34.31 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  36.89 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  44.33 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  32.08 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  27.96 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  38.24 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  39.67 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  28.89 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  28.96 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  39.58 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  39.39 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  31.48 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  39.39 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  32.35 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  32.65 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  33.63 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  40.95 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  28.02 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  28.95 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  36.29 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  39.39 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  40.4 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  30.72 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  39.39 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  39.39 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  26.63 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  33.75 
 
 		 259 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  37.5 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  34.62 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  35.58 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  36.36 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  36.79 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  36.36 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  36.43 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  36.36 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  39.8 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  32.47 
 
 		 259 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  32.47 
 
 		 259 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  38.78 
 
 		 266 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  32.47 
 
 		 259 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  36.36 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1782  Smr domain-containing protein  36.36 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>