181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0844 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  100 
 
 
205 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  77.89 
 
 
200 aa  300  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  77.37 
 
 
200 aa  298  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  46.32 
 
 
189 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  47.45 
 
 
188 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  49.74 
 
 
191 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  48.55 
 
 
179 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  47.95 
 
 
180 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  43.85 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  44.32 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  44.81 
 
 
196 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  42.29 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  40.34 
 
 
198 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  51.35 
 
 
211 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  41.81 
 
 
202 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  40.23 
 
 
194 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  37.7 
 
 
213 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  38.66 
 
 
196 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  39.08 
 
 
192 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  37.82 
 
 
202 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  55.45 
 
 
262 aa  104  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 
199 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  36.51 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  34.9 
 
 
197 aa  98.2  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  32.65 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  53.47 
 
 
256 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  36.46 
 
 
198 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  52.48 
 
 
261 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  50.5 
 
 
185 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 
186 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  34.17 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  34.17 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  36.93 
 
 
200 aa  89  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  42.98 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  41.67 
 
 
179 aa  82  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  37.84 
 
 
450 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  45.92 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  30.15 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  37.84 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  32.08 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  40.54 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  25.64 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  34.86 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  40.21 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  32.09 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  36.52 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  37.25 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  33 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  38.38 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  23.24 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  36.94 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  30.81 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  36.04 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  36.04 
 
 
270 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  36.04 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  37.86 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  33.33 
 
 
313 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  29.47 
 
 
190 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  36.04 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  34.86 
 
 
240 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  31.63 
 
 
256 aa  61.6  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  36.54 
 
 
196 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  35.59 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  35.58 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  30.77 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  35.38 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2895  Smr protein/MutS2  36.84 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972637  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  35.58 
 
 
196 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  27.41 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  36 
 
 
182 aa  58.9  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  35.29 
 
 
186 aa  58.9  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  27.89 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  27.18 
 
 
189 aa  58.2  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  37.62 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  37.62 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  38.78 
 
 
259 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1818  Smr domain-containing protein  41.05 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  34.62 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  30.56 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  34.62 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  34.62 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  38.54 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  34.62 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  44.32 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  34.62 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  32.59 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  37.62 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  37.62 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  34.21 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1782  Smr domain-containing protein  37.62 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  38.78 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  34.21 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  37.62 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  38.78 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  38.78 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  37.62 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  34.21 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  34.21 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  34.21 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.188512 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>