135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0284 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 196 aa  383  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2895  Smr protein/MutS2  50.48 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972637  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  33.81 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  33.81 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  31.02 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  32.14 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  30.66 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  36.04 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  26.85 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  33.49 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  42 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  32.69 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  32.49 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  33 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  29.76 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  30.24 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  29.76 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  29.44 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  28.43 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  30.15 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  35.62 
 
 		 364 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  31.28 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  31.28 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  30.53 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  30.3 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  28.12 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  30.61 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  29.84 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  30.43 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  36.94 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  32 
 
 		 369 aa  57  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  33.06 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  38.68 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  37.62 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  29.41 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  34.38 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  26.04 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  27.6 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  40.22 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  38.46 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  27.27 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  25.52 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  31.29 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  31.29 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  32.08 
 
 		 450 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  38.46 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  38.46 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  30.28 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  30.28 
 
 		 180 aa  51.2  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  39.13 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  35.34 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  39.08 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  24.77 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  36.67 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3472  hypothetical protein  26.35 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  29.13 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  34.91 
 
 		 275 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  29.65 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  28.4 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  25.76 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  28.43 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1403  hypothetical protein  32.1 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0379  hypothetical protein  32.1 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  29.25 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  34.58 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  40.58 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1539  Smr protein/MutS2  34.67 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  39.51 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  31.53 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2595  hypothetical protein  34.57 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1512  hypothetical protein  32.1 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  35.79 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  34.17 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  31.13 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  29.9 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  34.17 
 
 		 270 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  25.65 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  27.66 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  30.97 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  27.22 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  37.21 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  26.85 
 
 		 242 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  30.56 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  25.65 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  27.89 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  32.38 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  29.25 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  29.35 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  24.62 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  28.24 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  34.29 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  32.38 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  30.34 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  32.38 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  32.38 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  32.38 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  34.17 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  32.38 
 
 		 292 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>