205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2902 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  99.49 
 
 		 198 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  86.36 
 
 		 198 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  56.22 
 
 		 197 aa  207  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0189  Smr protein/MutS2  51.71 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524914  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2787  Smr protein/MutS2  55.88 
 
 		 202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  51.26 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0119  Smr protein/MutS2  42.64 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0402  Smr protein/MutS2  40.8 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953066  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0419  Smr protein/MutS2  41.33 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2982  Smr protein/MutS2  37.69 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0307  Smr protein/MutS2  39.62 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0109  Smr protein/MutS2  39.57 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0302228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0154  hypothetical protein  38.14 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0301  Smr protein/MutS2  41.62 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0582  Smr protein/MutS2  34.36 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  36.55 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3218  Smr protein/MutS2  34.78 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  44 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2076  Smr family protein  34.16 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3944  Smr protein/MutS2  34.3 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1996  Smr family protein  33.66 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0844  Smr protein/MutS2  34.17 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3715  Smr protein/MutS2  50.96 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  32.68 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  33.86 
 
 		 450 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3487  Smr protein/MutS2  34.38 
 
 		 180 aa  85.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1144  Smr protein/MutS2  34.72 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00126532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0011  DNA repair protein  45.71 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27196  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1679  Smr protein/MutS2  50.5 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2050  Smr protein/MutS2  38.12 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398332  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1000  Smr protein/MutS2  49.04 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3113  Smr protein/MutS2  34.16 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  27.63 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  36.79 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  35.77 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1376  Smr protein/MutS2  47.12 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104289  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  32.99 
 
 		 275 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  29.63 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  20.21 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2018  Smr protein/MutS2  36.84 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3832  Smr protein/MutS2  36.14 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.334235  normal  0.0950687 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  31.37 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1293  Smr domain-containing protein  36.51 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.564372  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0797  Smr domain-containing protein  21.99 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0284  Smr protein/MutS2  31.51 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5040  Smr protein/MutS2  41.67 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1562  Smr protein/MutS2  47 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  34.23 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1841  Smr protein/MutS2  47 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.1304  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  34.58 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  38.39 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  36.09 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  35.65 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2040  Smr domain-containing protein  33.59 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278249  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  36.45 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  28.33 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  27 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2895  Smr protein/MutS2  30.53 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  32.28 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  27.98 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  28.08 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  36.45 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  31.49 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0350  Smr protein/MutS2  36.54 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000775937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0369  Smr protein/MutS2  35.51 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  34.82 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  27.96 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  27.36 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  26.56 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  27.96 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  36.7 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  27.69 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  26.56 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  33.04 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  27 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  32.71 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  40.78 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  36.89 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  30.63 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  32.71 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  32.71 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  27.18 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  39.39 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  35.58 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  31.53 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  32.14 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  26.19 
 
 		 180 aa  51.6  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  31.58 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  33.33 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  31.78 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  31.48 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  34.58 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  32.38 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  33.64 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  30.84 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  31.13 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  30.84 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>