195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1512 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1512  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1403  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0379  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3376  hypothetical protein  79.55 
 
 		 176 aa  297  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2813  hypothetical protein  73.71 
 
 		 180 aa  274  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1451  hypothetical protein  73.71 
 
 		 180 aa  274  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.730382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3472  hypothetical protein  72.73 
 
 		 183 aa  271  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1343  hypothetical protein  69.83 
 
 		 181 aa  265  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1325  Smr protein/MutS2  71.02 
 
 		 183 aa  265  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2483  hypothetical protein  71.02 
 
 		 183 aa  265  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2709  hypothetical protein  71.02 
 
 		 183 aa  265  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1321  hypothetical protein  71.02 
 
 		 183 aa  265  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2626  hypothetical protein  71.02 
 
 		 183 aa  265  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02256  hypothetical protein  70.45 
 
 		 183 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2488  hypothetical protein  70.45 
 
 		 183 aa  263  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00371874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02216  hypothetical protein  70.45 
 
 		 183 aa  263  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2615  hypothetical protein  68.75 
 
 		 183 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.543834  normal  0.365582 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2575  hypothetical protein  68.75 
 
 		 183 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2526  hypothetical protein  68.75 
 
 		 183 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2739  hypothetical protein  68.75 
 
 		 183 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2628  hypothetical protein  68.75 
 
 		 183 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000704503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2595  hypothetical protein  70.52 
 
 		 180 aa  258  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2879  hypothetical protein  68.18 
 
 		 183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0178809  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  54.6 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03116  hypothetical protein  56.82 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002861  hypothetical protein  56.25 
 
 		 176 aa  211  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1701  hypothetical protein  58.08 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1352  hypothetical protein  50.6 
 
 		 168 aa  188  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  49.46 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2669  hypothetical protein  54.22 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1016  Smr protein/MutS2  53.29 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2590  hypothetical protein  53.33 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2453  hypothetical protein  53.94 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  51.52 
 
 		 174 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2418  hypothetical protein  52.69 
 
 		 175 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1636  hypothetical protein  52.87 
 
 		 176 aa  177  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.788761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3081  hypothetical protein  52.15 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1414  hypothetical protein  52.15 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1467  hypothetical protein  52.15 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2754  hypothetical protein  51.52 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1605  hypothetical protein  51.52 
 
 		 176 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.275646  normal  0.0937643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2771  hypothetical protein  51.52 
 
 		 176 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1479  hypothetical protein  51.53 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.390428  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2848  hypothetical protein  50.91 
 
 		 176 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000819227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1535  hypothetical protein  51.83 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2161  hypothetical protein  52.76 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1539  Smr protein/MutS2  45.9 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02757  Smr protein/MutS2  46.95 
 
 		 216 aa  141  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0356192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  34.52 
 
 		 224 aa  91.3  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  33.15 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  38.31 
 
 		 266 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  34.12 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  35.47 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  33.53 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  33.53 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  32.39 
 
 		 180 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  38.24 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  30.41 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  36.57 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  38.13 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  29.51 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  31.38 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  35.12 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  35.82 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  37.88 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  33.91 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  33.91 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  33.91 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  33.91 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  33.91 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  33.91 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  33.91 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  38.69 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  34.44 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  32.74 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  35.92 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  31.22 
 
 		 292 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  32.39 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  34.85 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  39.02 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  32.75 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  38.21 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  27.17 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  34.09 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  34.09 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  34.09 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  34.65 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  28.89 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  28.81 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  34.88 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  31.15 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  28.81 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  37.1 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  34.88 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  28.81 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  27.87 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  30.68 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  27.37 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  28.25 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  30.11 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>