238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1535 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1535  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2669  hypothetical protein  76 
 
 		 175 aa  285  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1479  hypothetical protein  75.14 
 
 		 197 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.390428  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3081  hypothetical protein  75.57 
 
 		 176 aa  279  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1414  hypothetical protein  75.57 
 
 		 176 aa  279  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1467  hypothetical protein  75.57 
 
 		 176 aa  280  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2754  hypothetical protein  74.43 
 
 		 176 aa  277  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1605  hypothetical protein  74.43 
 
 		 176 aa  276  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.275646  normal  0.0937643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2771  hypothetical protein  74.43 
 
 		 176 aa  276  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2848  hypothetical protein  74.43 
 
 		 176 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000819227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2453  hypothetical protein  73.86 
 
 		 176 aa  271  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  69.94 
 
 		 174 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1636  hypothetical protein  68.79 
 
 		 176 aa  251  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.788761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2590  hypothetical protein  67.8 
 
 		 176 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2418  hypothetical protein  66.86 
 
 		 175 aa  238  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2161  hypothetical protein  67.47 
 
 		 176 aa  235  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3376  hypothetical protein  52.02 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3472  hypothetical protein  52.44 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2739  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2628  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000704503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2526  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2615  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.543834  normal  0.365582 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2575  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2595  hypothetical protein  60.48 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1016  Smr protein/MutS2  47.46 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02256  hypothetical protein  50.6 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1325  Smr protein/MutS2  50.6 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1321  hypothetical protein  50.6 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2483  hypothetical protein  50.6 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2488  hypothetical protein  50.6 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00371874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2709  hypothetical protein  50.6 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02216  hypothetical protein  50.6 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2626  hypothetical protein  50.6 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  47.78 
 
 		 231 aa  163  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1343  hypothetical protein  61.29 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2813  hypothetical protein  48.84 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1451  hypothetical protein  48.84 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.730382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2879  hypothetical protein  48.8 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0178809  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1352  hypothetical protein  47.59 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0379  hypothetical protein  51.61 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1701  hypothetical protein  48.24 
 
 		 186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1403  hypothetical protein  51.61 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1512  hypothetical protein  51.61 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  47.31 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03116  hypothetical protein  47.8 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002861  hypothetical protein  47.8 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02757  Smr protein/MutS2  45.95 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0356192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1539  Smr protein/MutS2  46.15 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  32.12 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  32.12 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  32.74 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  32.56 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  31.28 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  41.05 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  35.25 
 
 		 252 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  35.66 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  38.95 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  36.59 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  41.05 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  43.62 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  41.18 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  30.9 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  30.9 
 
 		 259 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  30.9 
 
 		 259 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  30.18 
 
 		 278 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  31.36 
 
 		 247 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  38.95 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  30.18 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  35.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  35.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  35.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  35.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  35.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  35.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  35.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  30.95 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  31.21 
 
 		 259 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  40.82 
 
 		 226 aa  67.4  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  38.78 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  41.18 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  29.65 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  30.23 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  28.98 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  39.81 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  29.94 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  32.85 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  32.85 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  39.81 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  29.07 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  40 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  32.8 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  39.58 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  28 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  27.01 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  27.59 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  30.91 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3112  Smr protein/MutS2  29.48 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  29.89 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  37.23 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>