233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1605 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2771  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1605  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.275646  normal  0.0937643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2848  hypothetical protein  99.43 
 
 
176 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000819227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2754  hypothetical protein  99.43 
 
 
176 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3081  hypothetical protein  95.45 
 
 
176 aa  353  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1479  hypothetical protein  94.89 
 
 
197 aa  353  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.390428  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1414  hypothetical protein  94.89 
 
 
176 aa  352  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2453  hypothetical protein  94.32 
 
 
176 aa  348  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1467  hypothetical protein  93.18 
 
 
176 aa  345  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0196925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2669  hypothetical protein  77.01 
 
 
175 aa  289  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1535  hypothetical protein  74.43 
 
 
177 aa  276  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2590  hypothetical protein  73.3 
 
 
176 aa  276  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2418  hypothetical protein  75.14 
 
 
175 aa  274  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  73.68 
 
 
174 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1636  hypothetical protein  72.16 
 
 
176 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.788761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2161  hypothetical protein  68.18 
 
 
176 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3472  hypothetical protein  52.07 
 
 
183 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2615  hypothetical protein  51.48 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.543834  normal  0.365582 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2526  hypothetical protein  51.48 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2628  hypothetical protein  51.48 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000704503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2739  hypothetical protein  51.48 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2575  hypothetical protein  51.48 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2879  hypothetical protein  51.48 
 
 
183 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0178809  normal  0.225748 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02256  hypothetical protein  50.89 
 
 
183 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02216  hypothetical protein  50.89 
 
 
183 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2488  hypothetical protein  50.89 
 
 
183 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00371874  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1325  Smr protein/MutS2  50.89 
 
 
183 aa  175  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2483  hypothetical protein  50.89 
 
 
183 aa  175  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2626  hypothetical protein  50.89 
 
 
183 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1321  hypothetical protein  50.89 
 
 
183 aa  175  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2709  hypothetical protein  50.89 
 
 
183 aa  175  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3376  hypothetical protein  48.52 
 
 
176 aa  168  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0379  hypothetical protein  51.28 
 
 
176 aa  167  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1403  hypothetical protein  51.28 
 
 
176 aa  167  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1512  hypothetical protein  51.28 
 
 
203 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  50.93 
 
 
231 aa  166  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1352  hypothetical protein  50.6 
 
 
168 aa  166  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1343  hypothetical protein  49.42 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2813  hypothetical protein  50 
 
 
180 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1451  hypothetical protein  50 
 
 
180 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.730382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2595  hypothetical protein  58.46 
 
 
180 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002861  hypothetical protein  47.67 
 
 
176 aa  160  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03116  hypothetical protein  47.09 
 
 
176 aa  158  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1016  Smr protein/MutS2  46.75 
 
 
178 aa  158  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02757  Smr protein/MutS2  47.95 
 
 
216 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0356192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1539  Smr protein/MutS2  47.31 
 
 
186 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1701  hypothetical protein  44.25 
 
 
186 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  44.63 
 
 
177 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  33.53 
 
 
221 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  33.13 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  33.13 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  36.8 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  36.43 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  30.6 
 
 
196 aa  72  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  36.89 
 
 
196 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  36.89 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  35.09 
 
 
266 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  32.92 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  34.4 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  37.4 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  35.42 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  26.4 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  36.07 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  28.41 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  39.05 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  39.05 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  36.89 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  30.64 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  30.64 
 
 
259 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  30.64 
 
 
259 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  30.72 
 
 
278 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  30.72 
 
 
259 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  37.38 
 
 
196 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  37.38 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  37.38 
 
 
196 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  37.38 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  39.05 
 
 
219 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  37.38 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  30.12 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  25.84 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  34.15 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  31.74 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  31.74 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  31.74 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  31.74 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  31.74 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  31.74 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  31.74 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  25.84 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  23.98 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  23.63 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  31.58 
 
 
247 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  33.83 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  29.65 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  28.25 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  31.55 
 
 
256 aa  63.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3112  Smr protein/MutS2  29.31 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  29.65 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  33.82 
 
 
226 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>