275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3443 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  95.58 
 
 		 299 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  66.14 
 
 		 259 aa  321  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  66.14 
 
 		 259 aa  321  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  65.74 
 
 		 259 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  75.6 
 
 		 266 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  71.14 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  68.4 
 
 		 292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  65.34 
 
 		 278 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  65.74 
 
 		 259 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  70.49 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  70.49 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  70.49 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  70.08 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  70.49 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  70.49 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  70.49 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  65.55 
 
 		 259 aa  294  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  59.02 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  61.27 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  60.78 
 
 		 221 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  55.17 
 
 		 217 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  60.29 
 
 		 221 aa  218  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  59.02 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  56.67 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  55.83 
 
 		 234 aa  215  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  61.58 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  58.14 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  54.67 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  59.89 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  59.28 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  58.24 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  60 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  47.64 
 
 		 211 aa  168  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  48.55 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  55.24 
 
 		 179 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  47.06 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  49.7 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  43.37 
 
 		 368 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  45.29 
 
 		 178 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  43.43 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  43.86 
 
 		 186 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  40.74 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  47.45 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  47.45 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  38.51 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  46.28 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  46.28 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  46.77 
 
 		 180 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  37.57 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  46.77 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  37.43 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  39.08 
 
 		 197 aa  105  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  37.5 
 
 		 185 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  32.22 
 
 		 199 aa  98.6  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  41.27 
 
 		 186 aa  98.6  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  41.46 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  41.46 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  34.48 
 
 		 185 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  36.79 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  31.67 
 
 		 180 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  38.01 
 
 		 180 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  47.9 
 
 		 178 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  37.14 
 
 		 181 aa  95.9  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  36 
 
 		 185 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  35.23 
 
 		 186 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  35.23 
 
 		 186 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  37.08 
 
 		 186 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  35.43 
 
 		 185 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  35.8 
 
 		 179 aa  94.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  45.39 
 
 		 189 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  34.85 
 
 		 313 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  36.47 
 
 		 190 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  34.09 
 
 		 185 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  34.15 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  38.18 
 
 		 180 aa  92.4  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  43.9 
 
 		 177 aa  92  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  41.14 
 
 		 234 aa  91.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  39.39 
 
 		 186 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  35.45 
 
 		 364 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  37.43 
 
 		 450 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  32.39 
 
 		 190 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  38.05 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  40 
 
 		 213 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  33.66 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  41.59 
 
 		 179 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  28.71 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  31.69 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2879  hypothetical protein  32.76 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0178809  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2595  hypothetical protein  31.32 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1886  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  29.08 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  37.96 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1701  hypothetical protein  36.84 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  36.36 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2590  hypothetical protein  35.71 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1016  Smr protein/MutS2  31.84 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02256  hypothetical protein  35.71 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2488  hypothetical protein  35.71 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00371874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  35.96 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>