228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1432 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  93.55 
 
 		 186 aa  358  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  93.01 
 
 		 186 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  92.47 
 
 		 186 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  81.18 
 
 		 185 aa  315  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  79.03 
 
 		 185 aa  308  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  81.18 
 
 		 185 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  77.96 
 
 		 185 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  72.58 
 
 		 185 aa  285  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  73.12 
 
 		 185 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  72.73 
 
 		 186 aa  279  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  45.51 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  38.29 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  37.02 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  41.08 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  38.64 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  37.36 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  37.36 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  35.16 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  39.44 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  36.87 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  36.87 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  39.89 
 
 		 205 aa  104  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  34.43 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01397  Smr domain (Small MutS Related) containing protein  31.87 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  40.91 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  40.91 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  38.29 
 
 		 219 aa  101  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  33.87 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  33.15 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  37.57 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  33.15 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  35.33 
 
 		 278 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  35.56 
 
 		 292 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  37.79 
 
 		 234 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  35.8 
 
 		 247 aa  99.4  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  34.44 
 
 		 192 aa  99  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1893  Smr protein/MutS2  38.71 
 
 		 197 aa  98.6  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  35.43 
 
 		 245 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  35.43 
 
 		 245 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  34.83 
 
 		 259 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  34.83 
 
 		 259 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  34.83 
 
 		 259 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  35.43 
 
 		 245 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  35.43 
 
 		 245 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  35.43 
 
 		 245 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  35.43 
 
 		 245 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  35.43 
 
 		 245 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  35.23 
 
 		 266 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  40.58 
 
 		 227 aa  97.4  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  41.13 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  34.27 
 
 		 259 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  30.56 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  34.44 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  35.23 
 
 		 252 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  35.36 
 
 		 217 aa  95.5  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  36.31 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  32.58 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  40 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  33.52 
 
 		 299 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  32.22 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  32.78 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  32.22 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002861  hypothetical protein  33.14 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  37.88 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  35.2 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3112  Smr protein/MutS2  37.1 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1701  hypothetical protein  34.48 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03116  hypothetical protein  34.86 
 
 		 176 aa  91.3  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  39.84 
 
 		 230 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  31.67 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  31.67 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  31.67 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  36.09 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  32.39 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  33.92 
 
 		 259 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  39.84 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  34.97 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  31.11 
 
 		 196 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  36.09 
 
 		 218 aa  88.6  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  33.58 
 
 		 224 aa  88.6  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  38.84 
 
 		 257 aa  87.8  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  38.02 
 
 		 257 aa  87.8  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  30.56 
 
 		 196 aa  87.8  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  31.11 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  36.51 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  28.9 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  35.48 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  32.78 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  39.84 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2418  hypothetical protein  29.71 
 
 		 175 aa  85.1  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1016  Smr protein/MutS2  30.68 
 
 		 178 aa  85.1  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  32.57 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  34.65 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  34.65 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  28.41 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1820  Smr protein/MutS2  29.89 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  42.86 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2096  Smr protein/MutS2  30 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  30.17 
 
 		 275 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>