221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2341 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  52.04 
 
 		 196 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  46.43 
 
 		 196 aa  185  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  45.92 
 
 		 196 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  45.41 
 
 		 196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  44.9 
 
 		 213 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  44.9 
 
 		 196 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  44.9 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  45.41 
 
 		 196 aa  175  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  44.39 
 
 		 196 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  45.92 
 
 		 196 aa  174  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1886  Smr protein/MutS2  48.5 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  44.39 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01397  Smr domain (Small MutS Related) containing protein  37.37 
 
 		 195 aa  150  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1818  Smr domain-containing protein  40.31 
 
 		 218 aa  140  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2054  Smr protein/MutS2  38.58 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  36.98 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  38.02 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  38.54 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  39.71 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  41.3 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3112  Smr protein/MutS2  38.92 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  35.52 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2096  Smr protein/MutS2  32.98 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  33.51 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  33.51 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.611909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  33.51 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  33.51 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  33.51 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  33.51 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1857  Smr protein/MutS2  31.94 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1782  Smr domain-containing protein  33.51 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  44.19 
 
 		 190 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1457  Smr domain-containing protein  32.98 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1585  Smr domain protein  32.98 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  32.98 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1843  Smr protein/MutS2  32.98 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  32.98 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  32.98 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  32.98 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  31.91 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  34.44 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  34.44 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  31.89 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1820  Smr protein/MutS2  31.94 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  32.78 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  34.44 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  32.24 
 
 		 242 aa  94.7  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  33.88 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  32.02 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  33.88 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  30.17 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  31.67 
 
 		 178 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  30.89 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  32.97 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  32.4 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  32.42 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  33.7 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1893  Smr protein/MutS2  37.82 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  39.02 
 
 		 257 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  31.79 
 
 		 182 aa  89  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  38.21 
 
 		 257 aa  88.2  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  28.57 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  30.29 
 
 		 179 aa  85.5  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  31.15 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  32.57 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  33.33 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  29.83 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  39.09 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  29.55 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  29.55 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  29.55 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  37.19 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  38.18 
 
 		 252 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  33.33 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  38.18 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  31.07 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  39.09 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  29.31 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  31.03 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  31.03 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  30.46 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  31.03 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  31.03 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  31.03 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  31.03 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  31.03 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  30.11 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  29.55 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  31.2 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  37.27 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  30.68 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  29.14 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  30.29 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  28.42 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  27.87 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  32.73 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  32.73 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  34.51 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  28.41 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>