250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1289 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 186 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  54.49 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  43.79 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  48.19 
 
 		 219 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  44.44 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  45.86 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  43.26 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  45.71 
 
 		 292 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  45.29 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  43.35 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  45.61 
 
 		 247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  44.77 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  45.45 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  44.12 
 
 		 259 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  44.12 
 
 		 259 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  44.12 
 
 		 259 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  42.94 
 
 		 266 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  45.61 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  40.1 
 
 		 256 aa  121  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  42.35 
 
 		 278 aa  121  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  50 
 
 		 178 aa  121  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  42.2 
 
 		 227 aa  120  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  44.91 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  44.91 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  44.91 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  44.91 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  44.91 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  44.91 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  44.91 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  43.45 
 
 		 230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  42.29 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  41.76 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  43.53 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  44.24 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  39.43 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  43.53 
 
 		 299 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  42.6 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  40.83 
 
 		 218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  41.86 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  43.45 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  40 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  39.43 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  40 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  39.43 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  42.94 
 
 		 259 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  40.12 
 
 		 221 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  44.85 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  40.12 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  38.65 
 
 		 368 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  45.86 
 
 		 219 aa  111  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  37.3 
 
 		 242 aa  111  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  38.95 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  38.29 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  46.43 
 
 		 243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  38.64 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  38.86 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  41.92 
 
 		 234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  38.64 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  38.07 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  35.09 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  45.95 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  35.09 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  43.04 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  38.96 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  38.64 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  38.31 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  38.64 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  34.68 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  38.74 
 
 		 205 aa  98.2  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  46.67 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  38.58 
 
 		 257 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  39.37 
 
 		 257 aa  95.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  38.85 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  45 
 
 		 221 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  45 
 
 		 221 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  31.28 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  39.57 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  45 
 
 		 270 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  35.37 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  33.14 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  35.37 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  39.82 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  39.82 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  35.59 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  37.23 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  30.17 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  38.13 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  39.82 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1886  Smr protein/MutS2  32.61 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  37.5 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01397  Smr domain (Small MutS Related) containing protein  31.25 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  35.81 
 
 		 253 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  34.46 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  40 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1782  Smr domain-containing protein  32.16 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  39.81 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1585  Smr domain protein  32.16 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  32.16 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>