227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0415 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 253 aa  512  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  48.85 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  49.43 
 
 		 221 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  39.81 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  49.44 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  46.02 
 
 		 180 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  35.11 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  38.1 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  34.39 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  38.12 
 
 		 450 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  38.25 
 
 		 364 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  40.44 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  39.23 
 
 		 179 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  38.92 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  40.91 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  39.2 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  39.39 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  37.64 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  38.25 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  38.25 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  38.25 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  37.38 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  39.34 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  39.77 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  39.77 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  39.77 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  39.77 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  39.77 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  39.77 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  39.77 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  38.65 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  42.62 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  37.7 
 
 		 278 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  36.36 
 
 		 182 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  38.85 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  38.85 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  36.87 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  37.66 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  33.77 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  35.36 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  38.96 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  38.85 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  36.76 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  36.72 
 
 		 178 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  35.03 
 
 		 218 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  35.64 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  37.14 
 
 		 219 aa  92  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  44.26 
 
 		 192 aa  91.7  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  44.26 
 
 		 192 aa  91.7  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  37.69 
 
 		 205 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  36.22 
 
 		 181 aa  89.4  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  35.71 
 
 		 211 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  35.81 
 
 		 186 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  31.52 
 
 		 189 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  30.43 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  36.46 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  41.9 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  32.24 
 
 		 196 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  40 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  28.81 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  40 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1014  smr domain-containing protein  30.2 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.883954  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  37.62 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  32.62 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  41.35 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  28.34 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  32.98 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  29.68 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3112  Smr protein/MutS2  29.89 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  29.12 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  36.44 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  28.8 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  27.81 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  31.47 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  29.12 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  29.12 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  29.12 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  31.11 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  28 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  31.75 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  29.83 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  34.1 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  35.59 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  28 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  30.65 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  31.22 
 
 		 180 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  32.22 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  40 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  34.39 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  33.14 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  46.51 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  33.64 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  33.64 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  33.64 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  32.71 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4270  Smr protein/MutS2  31.78 
 
 		 188 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  30.91 
 
 		 204 aa  72  0.000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2552  Smr protein/MutS2-like  31.33 
 
 		 242 aa  72  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049818  hitchhiker  0.000000000032251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  27.43 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>