210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2220 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  98.05 
 
 
257 aa  520  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  62.6 
 
 
189 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  60.16 
 
 
189 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  41.8 
 
 
197 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  40.83 
 
 
190 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  44.26 
 
 
182 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  39.68 
 
 
186 aa  99.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  40.65 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  41.46 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  38.58 
 
 
186 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 
213 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  40.37 
 
 
196 aa  92.8  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  42.74 
 
 
205 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  41.96 
 
 
243 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  41.46 
 
 
266 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  41.07 
 
 
243 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  42.48 
 
 
180 aa  92  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  38.84 
 
 
186 aa  92  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  38.84 
 
 
185 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  39.02 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  38.02 
 
 
186 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  39.84 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  37.4 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  42.86 
 
 
181 aa  89.4  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  38.02 
 
 
186 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  39.84 
 
 
245 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  37.3 
 
 
223 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  39.84 
 
 
245 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  39.84 
 
 
245 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  39.84 
 
 
245 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  39.84 
 
 
245 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  39.84 
 
 
245 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  39.84 
 
 
245 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  89  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  37.1 
 
 
218 aa  88.6  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  39.02 
 
 
196 aa  89  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  36.36 
 
 
185 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  38.84 
 
 
185 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  37.19 
 
 
185 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  38.02 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  37.4 
 
 
230 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  34.68 
 
 
193 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  39.25 
 
 
178 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  40.57 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  35.54 
 
 
185 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  38.02 
 
 
186 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  37.4 
 
 
227 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  39.29 
 
 
242 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  36.43 
 
 
259 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  36.43 
 
 
259 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  36.43 
 
 
259 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  39.02 
 
 
292 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  38.46 
 
 
192 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  38.46 
 
 
192 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  36.43 
 
 
278 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  39.84 
 
 
217 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  35.77 
 
 
226 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  36.43 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  34.09 
 
 
193 aa  85.9  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1815  hypothetical protein  38.32 
 
 
192 aa  85.1  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  43.24 
 
 
179 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  35.54 
 
 
185 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  38.74 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  34.92 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  38.74 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  37.4 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  34.96 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  34.96 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  34.15 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01397  Smr domain (Small MutS Related) containing protein  38.32 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  35.2 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  45.35 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  31.75 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  32.46 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  32.46 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3112  Smr protein/MutS2  35.25 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  30.4 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  30.4 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  41.44 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  30.4 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  30.4 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  41.44 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  30.4 
 
 
196 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  31.58 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  39.25 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  37.14 
 
 
256 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  33.59 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  31.5 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  36.44 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  32.46 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  35.9 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  32.79 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  32.79 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  32.79 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  32.79 
 
 
187 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  32.79 
 
 
187 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  32.79 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  34.62 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>