273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3340 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  74.77 
 
 		 221 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  59.91 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  58.9 
 
 		 218 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  60 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  60.09 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  56.25 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  56.52 
 
 		 234 aa  214  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  62.8 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  59.88 
 
 		 226 aa  213  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  59.54 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  66.08 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  57.07 
 
 		 247 aa  208  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  54.33 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  62.64 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  52.66 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  52.66 
 
 		 221 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  60.59 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  60.59 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  60.59 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  60.59 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  60.59 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  60.59 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  60.59 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  52.17 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  61.85 
 
 		 299 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  53.85 
 
 		 292 aa  198  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  53.11 
 
 		 259 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  53.11 
 
 		 259 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  53.11 
 
 		 259 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  55.93 
 
 		 278 aa  194  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  52.55 
 
 		 259 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  52.11 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  49.41 
 
 		 219 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  45.86 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  43.5 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  44.37 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  51.88 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  51.88 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  44.37 
 
 		 256 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  42.2 
 
 		 186 aa  121  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  40.11 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  44.6 
 
 		 368 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  45.77 
 
 		 178 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  50.43 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  50.43 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  50.43 
 
 		 270 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  47.01 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  36.6 
 
 		 253 aa  104  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  40.74 
 
 		 185 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  40.58 
 
 		 186 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  39.2 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  40.31 
 
 		 185 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  41.6 
 
 		 186 aa  94.7  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  33.53 
 
 		 185 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  43.86 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  43.97 
 
 		 179 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  38.93 
 
 		 186 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  38.93 
 
 		 186 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  42.11 
 
 		 179 aa  93.2  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  42.11 
 
 		 180 aa  92.8  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  38.52 
 
 		 185 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  40.54 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  38.93 
 
 		 186 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  37.18 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  40.54 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  38.52 
 
 		 185 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  36.54 
 
 		 189 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  40.54 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  40.54 
 
 		 196 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  40.54 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  39.89 
 
 		 450 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  40.54 
 
 		 196 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  40.54 
 
 		 196 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  39.29 
 
 		 313 aa  89  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  40.54 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  36.8 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  51.85 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  36.8 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  38.46 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  32.2 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  38.84 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  38.21 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  37.1 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  42.48 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  38.98 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  36.7 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  45.13 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  31.21 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  34.51 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  41.46 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  31.21 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  38.21 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1403  hypothetical protein  38.06 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0379  hypothetical protein  38.06 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1512  hypothetical protein  38.06 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  37.57 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3472  hypothetical protein  33.77 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2626  hypothetical protein  36.09 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2483  hypothetical protein  36.09 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>