228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1679 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  56.35 
 
 		 450 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  45.8 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  46.26 
 
 		 232 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  50.77 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  45.85 
 
 		 364 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  39.81 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  43.6 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  43.02 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  42.29 
 
 		 221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  41.14 
 
 		 180 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  36.1 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  35.9 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  33.69 
 
 		 189 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  34.22 
 
 		 189 aa  96.3  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  33.5 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  33.5 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  37.63 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  35.5 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  33.5 
 
 		 259 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  36.93 
 
 		 245 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  36.93 
 
 		 245 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  36.93 
 
 		 245 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  36.93 
 
 		 245 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  36.93 
 
 		 245 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  36.93 
 
 		 245 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  36.93 
 
 		 245 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  33.16 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  34.39 
 
 		 259 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  39.16 
 
 		 221 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  34.48 
 
 		 182 aa  89.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3602  Smr protein/MutS2-like  40 
 
 		 196 aa  89.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0423401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  35.87 
 
 		 178 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0279  Smr protein/MutS2 C-terminal  35.24 
 
 		 204 aa  89.4  7e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  35.59 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0952  Smr domain-containing protein  29.76 
 
 		 166 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  36.31 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  36.57 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  32.22 
 
 		 186 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  37.43 
 
 		 217 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  37.41 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  33.71 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  32.04 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  38.85 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  38.46 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  33.9 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  32.96 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  32.02 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  45.19 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  31.68 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  33.14 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  30.17 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  29.61 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  31.87 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  33.14 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  31.87 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  46.15 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  29.61 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  30.9 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  35.37 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  30.9 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  30.9 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  30.9 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  30.77 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  34.43 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3443  Smr protein/MutS2  40.54 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2853  Smr protein/MutS2  38.94 
 
 		 200 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241064  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  31.35 
 
 		 196 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2902  Smr protein/MutS2  32.99 
 
 		 198 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  32.57 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  29.05 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  30.81 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  29.21 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1241  putative Smr protein/MutS2  31.79 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  28.88 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  30.34 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1246  Smr protein/MutS2  39.02 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.731198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  31.64 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0169  Smr domain-containing protein  34.04 
 
 		 369 aa  75.5  0.0000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  38.18 
 
 		 186 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  43 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  28.65 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  38.68 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  31.44 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004195  hypothetical protein  31.52 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000447075  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  32.18 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  32.42 
 
 		 181 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  31.61 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  28.65 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01259  hypothetical protein  30.98 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2678  Smr protein/MutS2  38.39 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  31.38 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  32.22 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0510  Smr protein/MutS2  32.29 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000504408  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  31.84 
 
 		 187 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  31.84 
 
 		 187 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  31.67 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  31.67 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>