244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1761 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  100 
 
 
368 aa  712    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  43.97 
 
 
256 aa  199  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  51.15 
 
 
226 aa  162  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  47.31 
 
 
224 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  48.81 
 
 
234 aa  155  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  47.78 
 
 
259 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  47.78 
 
 
259 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  47.78 
 
 
259 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  44.97 
 
 
266 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  46.33 
 
 
247 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  46.75 
 
 
292 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  44 
 
 
219 aa  149  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  46.71 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  46.71 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  46.71 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  46.15 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  46.71 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  46.71 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  46.71 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  46.71 
 
 
245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  46.75 
 
 
278 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  45.78 
 
 
218 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  49.01 
 
 
221 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  43.27 
 
 
223 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  47.31 
 
 
221 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  45.51 
 
 
221 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  45.51 
 
 
221 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  47.98 
 
 
211 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  44.97 
 
 
217 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  42.22 
 
 
179 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  49.62 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  49.62 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  44.44 
 
 
259 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  45.24 
 
 
230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  46.36 
 
 
227 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  45.51 
 
 
227 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  45.61 
 
 
178 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  40.23 
 
 
186 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  48.53 
 
 
226 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  42.26 
 
 
182 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  48.91 
 
 
192 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  48.91 
 
 
192 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  47.37 
 
 
219 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  37.43 
 
 
186 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  40.59 
 
 
181 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  32.98 
 
 
242 aa  101  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  41.76 
 
 
179 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  33.33 
 
 
199 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  42.42 
 
 
221 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  35.29 
 
 
180 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  41.67 
 
 
270 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  37.5 
 
 
180 aa  97.1  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  43.1 
 
 
189 aa  96.3  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  42.42 
 
 
221 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  42.5 
 
 
180 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  33.33 
 
 
313 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  26.5 
 
 
364 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  34.62 
 
 
179 aa  89.7  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  42.45 
 
 
253 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  31.77 
 
 
197 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2468  Smr protein/MutS2  43.81 
 
 
205 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  43.1 
 
 
178 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1444  Smr protein/MutS2  40.59 
 
 
243 aa  86.7  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0971  hypothetical protein  40.59 
 
 
243 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0507047  hitchhiker  0.00239069 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  40.62 
 
 
180 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  40.37 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  40 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  37.25 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  39.45 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  39.05 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  30.56 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  36.79 
 
 
257 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  40.19 
 
 
189 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  39.25 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  37.61 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  35.85 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  37.61 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  37.61 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  36.8 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  37.61 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  37.61 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  31.46 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  35.04 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3896  Smr protein/MutS2  37.08 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000432884  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1585  Smr domain protein  31.21 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  32.18 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3354  Smr protein/MutS2  36.13 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1818  Smr domain-containing protein  32.14 
 
 
218 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  38.68 
 
 
225 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.238987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01317  hypothetical protein  30.64 
 
 
187 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01327  hypothetical protein  30.64 
 
 
187 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.779445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2304  Smr protein/MutS2  30.64 
 
 
187 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  35.34 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1554  Smr domain-containing protein  30.06 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2285  Smr protein/MutS2  30.64 
 
 
187 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1988  Smr domain protein  30.06 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.611909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1675  Smr protein/MutS2  29.82 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.377417  normal  0.101642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1783  Smr protein/MutS2  29.82 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.399196  normal  0.131762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1781  Smr protein/MutS2  29.82 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1493  smr domain protein  29.82 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>