246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2992 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  100 
 
 
245 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  100 
 
 
245 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  99.59 
 
 
245 aa  480  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  100 
 
 
245 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  100 
 
 
245 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  100 
 
 
245 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  100 
 
 
245 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  93.52 
 
 
247 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  80.82 
 
 
292 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  78.46 
 
 
259 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  78.46 
 
 
259 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  78.05 
 
 
259 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  76.83 
 
 
278 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  77.24 
 
 
259 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  76.47 
 
 
259 aa  348  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  68.4 
 
 
266 aa  286  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  71.72 
 
 
252 aa  274  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  70.49 
 
 
299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  55.67 
 
 
234 aa  214  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  54.63 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  50.71 
 
 
217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  54.93 
 
 
221 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  60.71 
 
 
221 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  53.99 
 
 
221 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  59.54 
 
 
227 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  52.86 
 
 
230 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  54.15 
 
 
224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  57.47 
 
 
221 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  57.95 
 
 
218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  58.68 
 
 
226 aa  198  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  51.98 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  55.56 
 
 
219 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  64.93 
 
 
226 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  49.46 
 
 
219 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  47.98 
 
 
182 aa  164  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  49.7 
 
 
179 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  47.65 
 
 
211 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  41.08 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  45.88 
 
 
178 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  44.58 
 
 
368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  40.41 
 
 
186 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  45.61 
 
 
186 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  40 
 
 
197 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  36.46 
 
 
189 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  37.02 
 
 
189 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  45.86 
 
 
192 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  45.86 
 
 
192 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  39.77 
 
 
253 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  37.64 
 
 
185 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  36.67 
 
 
185 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  46.28 
 
 
180 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  46.11 
 
 
178 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  34.83 
 
 
186 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  37.22 
 
 
186 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  35 
 
 
186 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1679  Smr protein/MutS2  34.73 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.617343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  35.87 
 
 
185 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  44.63 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  35.43 
 
 
185 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  38.27 
 
 
450 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  46.62 
 
 
189 aa  95.1  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  34.27 
 
 
186 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  36.84 
 
 
181 aa  92.8  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  45.53 
 
 
177 aa  92.4  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  35.03 
 
 
186 aa  92  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  31.18 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  33.52 
 
 
196 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  34.95 
 
 
364 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  36.57 
 
 
190 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  32.58 
 
 
185 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  30.59 
 
 
180 aa  89.4  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  39.84 
 
 
257 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  39.84 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  32.02 
 
 
185 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  36.26 
 
 
179 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  34.48 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  39.09 
 
 
180 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  33.98 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  34.88 
 
 
180 aa  85.5  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  35.05 
 
 
225 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  31.65 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1441  Smr protein/MutS2-like  41.23 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  37.17 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  37.17 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  37.17 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  37.17 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  31.21 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  36.28 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  32.91 
 
 
221 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  36.31 
 
 
179 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1701  hypothetical protein  38.51 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3707  Smr protein/MutS2  32.18 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  38.74 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2341  Smr protein/MutS2  31.07 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  30.06 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  33.92 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  30.06 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  32 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1016  Smr protein/MutS2  34.29 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1539  Smr protein/MutS2  34.66 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>