242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2343 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  88.69 
 
 		 221 aa  363  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  89.14 
 
 		 221 aa  363  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  70.75 
 
 		 224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  65.09 
 
 		 223 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  60.29 
 
 		 292 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  58.37 
 
 		 259 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  58.37 
 
 		 259 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  58.37 
 
 		 259 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  56.94 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  58.33 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  58.33 
 
 		 259 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0833  Smr protein/MutS2  56.35 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  57.87 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  61.76 
 
 		 218 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  51.44 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  55.66 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  53.52 
 
 		 221 aa  208  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  54.33 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  60.48 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  60.48 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  60.48 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  60.48 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  60.48 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  60.48 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  60.48 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  55.61 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  54.55 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  54.72 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  60.41 
 
 		 299 aa  198  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  60.41 
 
 		 252 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1903  Smr protein/MutS2  61.41 
 
 		 219 aa  197  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3777  Smr protein/MutS2  61.76 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.854821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  46.89 
 
 		 256 aa  157  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  47.06 
 
 		 179 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  44.05 
 
 		 182 aa  145  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  46.11 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  44.44 
 
 		 178 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  41.05 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1761  Smr protein/MutS2  42.47 
 
 		 368 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4083  Smr protein/MutS2  47.74 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4050  Smr protein/MutS2  49.3 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3940  Smr protein/MutS2-like  46.45 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0493  Smr protein/MutS2  49.59 
 
 		 180 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769086 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  43.07 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  43.07 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  40.12 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  36.51 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0415  Smr protein/MutS2  36.32 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  37.57 
 
 		 181 aa  99  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  35.59 
 
 		 185 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  40.8 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0867  Smr domain-containing protein  35.26 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.283127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  41.13 
 
 		 185 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1457  Smr protein/MutS2  41.28 
 
 		 179 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.93693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1432  Smr protein/MutS2  39.04 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  41.13 
 
 		 186 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  31.84 
 
 		 199 aa  95.5  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0572  Smr protein/MutS2  37.43 
 
 		 180 aa  95.5  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  31.84 
 
 		 180 aa  95.1  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  40.31 
 
 		 185 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0620  hypothetical protein  35.5 
 
 		 179 aa  92  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  39.09 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0391  Smr protein/MutS2  32.97 
 
 		 232 aa  91.3  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  39.09 
 
 		 196 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  38.4 
 
 		 186 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2260  Smr protein/MutS2  39.09 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  37.13 
 
 		 185 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  39.09 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  38.4 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  32.95 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  38.18 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  33.14 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  36.53 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  37.39 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  33.72 
 
 		 189 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3162  Smr protein/MutS2  33.66 
 
 		 450 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0140456 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  33.14 
 
 		 189 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  33.53 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  38.39 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  38.39 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0379  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1343  hypothetical protein  34.68 
 
 		 181 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  36 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1403  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1649  Smr protein/MutS2  29.44 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  37.5 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1512  hypothetical protein  35.29 
 
 		 203 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1258  Smr protein/MutS2-like  37.84 
 
 		 180 aa  85.9  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.798752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  35.2 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2595  hypothetical protein  33.91 
 
 		 180 aa  85.5  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0927  Smr protein/MutS2  33.53 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  37.6 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2813  hypothetical protein  34.71 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2056  Smr protein/MutS2  32.8 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000826429  normal  0.140995 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1178  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1451  hypothetical protein  34.71 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.730382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2249  hypothetical protein  34.96 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2220  hypothetical protein  34.15 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1830  Smr protein/MutS2  51.22 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>