179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2813 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2813  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1451  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.730382  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1343  hypothetical protein  82.95 
 
 		 181 aa  307  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2595  hypothetical protein  80.23 
 
 		 180 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3472  hypothetical protein  73.14 
 
 		 183 aa  282  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2575  hypothetical protein  72.57 
 
 		 183 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2628  hypothetical protein  72.57 
 
 		 183 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000704503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3376  hypothetical protein  76.44 
 
 		 176 aa  281  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2526  hypothetical protein  72.57 
 
 		 183 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2739  hypothetical protein  72.57 
 
 		 183 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2615  hypothetical protein  72.57 
 
 		 183 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.543834  normal  0.365582 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1325  Smr protein/MutS2  73.14 
 
 		 183 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2626  hypothetical protein  73.14 
 
 		 183 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1321  hypothetical protein  73.14 
 
 		 183 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2483  hypothetical protein  73.14 
 
 		 183 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2709  hypothetical protein  73.14 
 
 		 183 aa  281  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02256  hypothetical protein  72.57 
 
 		 183 aa  279  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02216  hypothetical protein  72.57 
 
 		 183 aa  279  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2488  hypothetical protein  72.57 
 
 		 183 aa  279  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00371874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2879  hypothetical protein  70.29 
 
 		 183 aa  272  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0178809  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1512  hypothetical protein  74.25 
 
 		 203 aa  265  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0379  hypothetical protein  74.25 
 
 		 176 aa  265  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1403  hypothetical protein  74.25 
 
 		 176 aa  265  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1701  hypothetical protein  60.12 
 
 		 186 aa  217  8.999999999999998e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002861  hypothetical protein  56.9 
 
 		 176 aa  216  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  55.75 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03116  hypothetical protein  56.32 
 
 		 176 aa  215  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1352  hypothetical protein  52.41 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1016  Smr protein/MutS2  54.12 
 
 		 178 aa  181  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2669  hypothetical protein  53.29 
 
 		 175 aa  181  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  51.46 
 
 		 231 aa  177  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2418  hypothetical protein  52.54 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1636  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.788761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  47.9 
 
 		 174 aa  167  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2590  hypothetical protein  48.54 
 
 		 176 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1467  hypothetical protein  51.18 
 
 		 176 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1479  hypothetical protein  49.43 
 
 		 197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.390428  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2453  hypothetical protein  51.76 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3081  hypothetical protein  50.59 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1414  hypothetical protein  50.59 
 
 		 176 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1605  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.275646  normal  0.0937643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2771  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2848  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000819227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2754  hypothetical protein  49.41 
 
 		 176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1535  hypothetical protein  48.84 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2161  hypothetical protein  50.3 
 
 		 176 aa  157  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1539  Smr protein/MutS2  42.46 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02757  Smr protein/MutS2  46.02 
 
 		 216 aa  144  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0356192  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  32.95 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  32.95 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  34.52 
 
 		 224 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  32.4 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  34.73 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  31.74 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  32.74 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  33.94 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  32.74 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  34.29 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  29.71 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  31.4 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  30.29 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  33.92 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0374  Smr domain protein  38.35 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0544  Smr protein/MutS2  38.35 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39618  hitchhiker  0.00000321532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  31.46 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1000  hypothetical protein  42.86 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.143788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  29.44 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1289  Smr protein/MutS2  33.87 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  30.9 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  42.06 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  34.96 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  31.25 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  31.46 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  32.2 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  34.96 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  30.29 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2779  Smr protein/MutS2  37.41 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  37.41 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  29.71 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  28.79 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  26.86 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  33.14 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  33.14 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  30.6 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  26.86 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  37.1 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  33.14 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  33.14 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  33.14 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  33.14 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  33.14 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  31.65 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  29.71 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  29.71 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  29.71 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  37.4 
 
 		 217 aa  72  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0545  Smr protein/MutS2  31.28 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  35.97 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  32.62 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0947  Smr protein/MutS2  35.66 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.895393  normal  0.499289 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>