252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2418 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2418  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  362  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3019  hypothetical protein  79.41 
 
 		 174 aa  288  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.862772  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1636  hypothetical protein  79.41 
 
 		 176 aa  287  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.788761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2590  hypothetical protein  77.46 
 
 		 176 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1479  hypothetical protein  76.3 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.390428  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1467  hypothetical protein  76.3 
 
 		 176 aa  277  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3081  hypothetical protein  75.72 
 
 		 176 aa  276  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2453  hypothetical protein  76.3 
 
 		 176 aa  276  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1414  hypothetical protein  75.72 
 
 		 176 aa  275  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1605  hypothetical protein  75.14 
 
 		 176 aa  274  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.275646  normal  0.0937643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2754  hypothetical protein  75.14 
 
 		 176 aa  274  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2771  hypothetical protein  75.14 
 
 		 176 aa  274  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2848  hypothetical protein  74.57 
 
 		 176 aa  273  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000819227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2669  hypothetical protein  75 
 
 		 175 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1535  hypothetical protein  66.86 
 
 		 177 aa  238  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2161  hypothetical protein  65.22 
 
 		 176 aa  225  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002861  hypothetical protein  52.33 
 
 		 176 aa  181  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03116  hypothetical protein  51.74 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2739  hypothetical protein  53.18 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2628  hypothetical protein  53.18 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000704503 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2575  hypothetical protein  53.18 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2615  hypothetical protein  53.18 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.543834  normal  0.365582 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2526  hypothetical protein  53.18 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1701  hypothetical protein  53.18 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02256  hypothetical protein  53.25 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1325  Smr protein/MutS2  53.25 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2626  hypothetical protein  53.25 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2488  hypothetical protein  53.25 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00371874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1321  hypothetical protein  53.25 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2483  hypothetical protein  53.25 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2879  hypothetical protein  52.66 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0178809  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2709  hypothetical protein  53.25 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02216  hypothetical protein  53.25 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1451  hypothetical protein  52.54 
 
 		 180 aa  175  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.730382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2813  hypothetical protein  52.54 
 
 		 180 aa  175  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3472  hypothetical protein  52.66 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3376  hypothetical protein  50.89 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2595  hypothetical protein  51.72 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1343  hypothetical protein  52.98 
 
 		 181 aa  171  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1403  hypothetical protein  52.53 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1512  hypothetical protein  52.53 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0379  hypothetical protein  52.53 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1352  hypothetical protein  48.81 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2166  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1016  Smr protein/MutS2  47.7 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3153  hypothetical protein  47.34 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02757  Smr protein/MutS2  48.24 
 
 		 216 aa  154  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0356192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1539  Smr protein/MutS2  45.4 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1432  Smr protein/MutS2  29.71 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23700  mutS-related protein  28.65 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0024  Smr protein/MutS2-like  32.37 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  36.15 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1036  Smr protein/MutS2  36.15 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.407236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1118  Smr protein/MutS2  32.95 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348021  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1824  Smr domain-containing protein  29.55 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  32.53 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  32.53 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0683  Smr protein/MutS2  34.13 
 
 		 224 aa  77.4  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00169527  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  32.53 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3887  Smr protein/MutS2  29.55 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2037  Smr domain protein  28 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1402  Smr protein/MutS2  28.98 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0771614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2743  Smr protein/MutS2  26.29 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170121  normal  0.729725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1847  Smr protein/MutS2 C-terminal  28.16 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851791  normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2602  Smr protein/MutS2 C-terminal  29.07 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1906  Smr protein/MutS2-like  33.14 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.318936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1070  transcription factor jumonji, jmjC  31.64 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  36.59 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4034  Smr protein/MutS2  36.84 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3597  hypothetical protein  25.86 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2052  Smr protein/MutS2  30.77 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418346  normal  0.517442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1923  Smr protein/MutS2  30.77 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000517938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  35.38 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1716  Smr protein/MutS2-like  26.44 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42840  hypothetical protein  25.86 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1431  Smr protein/MutS2  30.59 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2495  Smr domain-containing protein  30.94 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2224  hypothetical protein  28 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00166  Smr domain protein  30.86 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  30.77 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0936  SMR/MUTS family protein  29.44 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2157  Smr protein/MutS2  30.22 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299005  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2124  Smr protein/MutS2  29.67 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.114209  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4533  hypothetical protein  29.67 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2169  Smr protein/MutS2  29.67 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.240266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2247  Smr protein/MutS2  29.67 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4246  Smr protein/MutS2  29.02 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214876  hitchhiker  0.0000000000382903 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1078  Smr domain-containing protein  29.44 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.267665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0904  Smr protein/MutS2  32.56 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1861  Smr protein/MutS2  29.78 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  30.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2253  hypothetical protein  26.86 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1292  Smr protein/MutS2 C-terminal  32.16 
 
 		 256 aa  67.8  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  30.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  30.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  30.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1992  Smr domain-containing protein  30.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  30.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  30.77 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  29.59 
 
 		 259 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>